解锁DNAMAN更多功能——

森严森语：

最近的一些学习和经历，让我产生一种很强烈的认知，那就是由于严重缺乏对身边触手可及的事物的了解，而导致在学习和生活过程中不能产生最大化的生产力。常表现的一种具体的现象就是费了很大的劲忙活半天达到的效果，在某种情况下分分钟就可以搞定。

我把这归结于缺乏对身边事物的观察和了解。毕竟很多时候我们没有能力创造新的技术和方法，但是如果能把现有的工具和技术在合理规划的情况下，大部分情况下就已经可以产生很强大的力量以满足我们在生活和学习中的需求。

比如：对于汽车驾驶技术的深度了解和掌握；对于手机、电脑等电子产品的深度了解和掌握；对于科研仪器的原理和使用方法的基本了解和掌握；对于逻辑语言和一些常用软件的基本认知和使用等。

不知，所以就慢。

【进入正题】

对于DNAMAN这款软件接触较早，但很陌生，因为唯一长期使用的一个功能就是多序列比对，其他功能均为触及。后来了解到有很多软件都可以进行多序列比对后，对于DNAMAN的使用次数就越来越少。于是，这款软件就在电脑的某个角落不知所措。

但是，打开这个软件一看就知道它有很多功能。今天有空，就重新打开这个软件对其涉及的基本功能进行一一解锁。

1、多序列比对

这里介绍3种导入序列的途径。

1.1 从channel导入

这种方式只能单条序列导入，不推荐。

如需进行多序列比对，需要逐一导入channel。比如下面：

导入后进行序列比对

比对结果如下，但是通常这种方式进行的双序列比对展示出来的结果不是很直观。

于是，可以采用多序列比对的方式进行。

然后持续下一步即可。

下面便是多序列比对结果：

1.2 从file导入

这种方式也只能在每个channel中单次导入一条序列，不推荐

1.3 将需要比对的序列保存为fasta格式的txt文本文档，直接进行多序列比对。推荐

下面一路下一步即可。

比对结束。

1.4 图片导出前的一些设置

这里可对图片进行一些必要的设置。根据自身需要摸索即可。较为简单，不一一行演示。比如这里进行如下设置。

1.5 然后导出

这里有两种导出途径

1.5.1 全局导出

下图为导出结果：

1.5.2 局部导出

选择需要展示的区间

2、酶切位点的分析

将需要分析的序列载入channel3，方法同上

这里根据展示的需要自行设置即可

这里选择几个常用的酶切位点

结果如下:

这可以看到主要结果如下：

通过这个结果即可在质粒构建中选择合适的酶切位点。

3、引物设计

引物设计功能不推荐使用。

4、蛋白质翻译及相关

4.1 载入序列

4.2 翻译

点击工具栏-protein-translation

4.3 将蛋白序列载入channel4，进行进一步分析

4.4 序列组分属性

4.5 二级结构预测

4.6 跨膜结构域预测

4.7 信号肽预测

关于DNAMAN的基本使用就简单介绍到这里。