肺癌相关文献5

第十一篇

Identifying prognostic genes related PANoptosis in lung adenocarcinoma and developing prediction model based on bioinformatics analysis
IF:4.6 中科院分区:2区 综合性期刊

亮点

1.免疫得分方法：TIMER, quanTIseq, CIBERSORT, xCell, MCPcounter, and EPIC
2.HPA数据库可做免疫组化验证

第十二篇

Cancer immunology. Mutational landscape determines sensitivity to PD-1 blockade in non-small cell lung cancer
IF:56.9 中科院分区:1区 综合性期刊 WOS分区:Q1

具有持久临床获益 （DCB）（部分或稳定缓解持续 >6 个月）的患者中非同义突变的中位数为 302 例，而无持久获益 （NDB） 的患者为 148 例 （Mann-Whitney P = 0.02） （图1A).73% 的高非同义负荷患者（定义为高于队列的中位负荷，209 例）经历了 DCB，而低突变负荷（低于中位数）的患者中有 13% 经历了 DCB（Fisher 的精确 P = 0.04）。在非同义负荷高的患者中，确诊的客观缓解率（ORR）和无进展生存期（PFS）均较高[ORR 63% vs 0%，Fisher’s exact P = 0.03;中位PFS 14.5 vs 3.7个月，log-rank P = 0.01;风险比（HR）0.19,95%置信区间（CI）0.05-0.70]。
确定突变变化模式如何与帕博利珠单抗的临床益处相关（表S4和S5）。与NDB相比，DCB患者的C-to-A转位更频繁，C-to-T转换更不频繁（两者的Mann-Whitney P=0.01）。

第十三篇

Molecular Features of Cancer-associated Fibroblast Subtypes and their Implication on Cancer Pathogenesis, Prognosis, and Immunotherapy Resistance
IF:11.5 中科院分区:1区 医学WOS分区:Q1

转录因子分析
使用 Lambert 等人 （24） 描述的转录因子 （TF） 数据库，我们确定了哪些 CAF 亚型标记基因是 TF。为了鉴定基因调控网络，从SCENIC （25） （v1.1.2.2）中鉴定并提取了泛CAF特异性TF的靶基因。然后，我们评估了已鉴定的TF的靶基因是否在相同的泛CAF亚型中富集。