从Ensemble biomart批量获取基因信息

在数据分析中往往会得到一系列感兴趣的基因，这时候如果一个个去网站上搜索基因描述等信息就会比较麻烦。目前在网上查到的方法主要两种：（1）利用爬虫查询，容易遇到网不好或者访问被拒绝等不可控情况，如果是大批量查询的话就比较影响效率；（2）将数据库信息下载到本地，再利用R脚本根据genelist提取需要的信息。第二种也是本篇文章要记录的方法。

Step1: 去Ensemble biomart选择需要的数据库、物种及内容

这里是网址
http://uswest.ensembl.org/biomart/martview

数据库内容

Step2: 在“Export all results to ”栏选择需要的输出模式后点击"Go"，即可下载到相应的信息

Step3: 使用脚本提取目标gene信息

你学会了吗？