2022-07-25

Nat Comm | 评估稀有遗传突变患者患癌风险

原创 图灵基因 图灵基因 2022-07-25 11:03 发表于江苏

收录于合集#前沿分子生物学机制

来自西班牙的研究人员已经确定了罕见的遗传变异，这些变异使一些人容易在组织和器官中发生突变。这些突变可能反过来增加肿瘤形成的风险。

研究人员在《Nature Communications》上的一篇题为“The impact of rare germline variants on human somatic mutation processes”的文章中详细介绍了他们的结果。

随着时间的推移，个体组织和器官中发生的体细胞突变是癌症的主要原因。但是罕见的遗传变异对突变过程的贡献在很大程度上尚不清楚。

“之前已知一些负责改变体细胞突变模式的基因的例子，例如易患乳腺癌和卵巢癌的BRCA基因。”生物医学研究所（IRB Barcelona）基因组数据科学实验室负责人Fran Supek博士解释说。

但是这项新研究的结果确定了其他可以同样影响体细胞突变积累的基因。

“我们开发了一种方法，使我们能够识别与15种不同细胞机制相关的42个基因，这些基因会影响不同类型的体细胞突变的风险。”该研究的第一作者Mischan Vali-Pour博士解释说。

大多数与突变产生有关的机制都与受损DNA的修复缺陷有关。例如，研究人员将MSH3、EXO1、SETD2和MTOR等基因中的罕见遗传变异与DNA错配修复缺陷联系起来，而EXO1、PAXIP1、RIF1和WRN等基因中的变异与同源重组修复缺陷相关联。

这些缺陷导致基因组不稳定，减少了产生驱动基因突变所需的时间，而驱动基因突变是肿瘤发展所必需的。

该研究的局限性之一是与体细胞突变相关的可遗传因素具有很大的可变性，并且这些因素各自的患病率相对较低。从非欧洲血统的癌症患者那里获取更多的基因组数据可能会导致进一步的发现。

“随着越来越多的遗传数据变得可用，可能会发现癌症诱变的其他遗传易感因素。我们在这里考虑的‘罕见’基因变体，虽然它们中的每一种都只存在于少数个体中，但它们在形成癌症基因组和可能的癌症风险方面总体上非常重要。”基因系统实验室负责人、基因组调控中心（CRG）系统生物学项目协调员Ben Lehner博士总结道。

基于这项研究的未来工作可能有助于评估患者患上特定类型癌症的遗传风险，从而使其预防计划个性化和/或在早期发现该疾病。