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小陈医生——GEO数据下载与整理

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必应搜索GEO


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输入想下载的GSE数据号


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下载矩阵文件


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最后文件夹中要有三个文件

上面几行代码运行后，下面框里面选择镜像地址，选一个跟自己所在方位近的中科大的7，在下面一个红框地方输入7
按回车


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用代码下载GEO文件

R studio注释乱码问题.png

R studio注释乱码问题

双击图中方框启动即可

————————————————————————


运行完gset[[1]] 后，下面出现方框，显示GPL570, 指的是一个测序平台 .png

打开
芯片平台.xlxs 这个看我另一个题目为GEO芯片平台的文章

找到GPL570对应的R包是hgu133plus2

这个R包的名字是hgu133plus2.db

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