Nextstrain的安装教程

Nextstrain是一款利用病原体基因组数据,分析其分子进化和传播路线的平台,由 Trevor Bedford教授 的团队研发;它基于 Python、Java和Shell 等多种语言编写,可以在 macOS、Windows和Linux系统 中运行;如今,Nextstrain已被广泛应用于新冠、流感和登革热等多种病原体的进化分析,为传染病的分子流行病学研究 和公共卫生监测事业 提供帮助。

         Trevor Bedford(Trevor Bedford)是美国Fred Hutchinson癌症研究中心下 疫苗和传染病部门的教授,致力于研究病毒基因组序列,以此了解病毒进化 和驱动病毒爆发和流行的因素。


本文主要介绍Nextstrain的安装流程,可以在官网或Github上了解到更多的原理和功能。

官网链接:Welcome to Nextstrain’s documentation! — Nextstrain documentation

Github链接:Nextstrain · GitHub

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