学习小组Day5笔记--lele

主要是学习R语言的数据结构，理解和使用向量和数据框。

向量

1.标量和向量的区分
理解元素、向量和标量
元素：指的是数字或者字符串（用chr表示）等
向量：多个元素组成的变量
标量：一个元素组成的变量

x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1，2，3组成的向量。b
x<- 1:10 #从1-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

2.从向量中提取元素
（1）根据元素位置

#这里的x是你刚才赋值的变量名，根据自己的情况来修改
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素

（2）根据值

x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c（1，2，5）中的元素

数据框

1.读取本地数据

X<-read.csv('doudou.txt')#用该命令可获得示例数据框
read.table(file ="huahua.txt",sep="\t",header =T)
a<-read.table(file ="huahua.txt", sep ="\t", header =T)
testa<-read.csv('huahua.txt')

2.设置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号，1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名

3.数据框的导出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号，字符串不加双引号（默认格式带由双引号） 

4.变量的保存与重新加载

#这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令

5.提取元素

- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列（优秀写法，而且这个命令还优秀到不用写括号的地步，并且支持Tab自动补全哦，不过只能提取一列）

6.直接使用数据框中的变量
方法1：attach

#第一种
options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(a$case,a$values)#这里的case和values是两个单纯的列名
#第二种
#将数据框名添加到搜索环境中：attach（a）,作图时就只需输入列名(连$都不用了)。
attach(a)
plot(case,values)
detach（a）#做完后将a删除出搜索环境

方法2：with

with(a,{
 plot(case,values)
x<<-summary(values)   #求和并赋值给x,<<的意思是作为全局变量，也就是出了大括号仍有效。
})
x #运行完后打印x

脚本的使用和保存：脚本文件的后缀就是R

作业：save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found，是为什么，应该怎么解决？
大小写严格区分，返回查看前面的x是大写还是小写。