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#生物信息生物学生物信息学
胚系突变(GermlineMutation)和体细胞突变(SomaticMutation)在WES、WGS、GenePanel检测时常常遇到,二者最大的区别是胚系突变可以遗传给后代,而体细胞突变不能够遗传给后代。本文将从形成原因、遗传性、功能、发生时期、变异检测几个方面介绍二者的区别。上图,直观理解二者区别形成原因Germlinemutations主要是由于生殖细胞(germcells)突变导致,
- cyvcf2 常用知识点
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PythonVCFcyvcf2vcf数据分析
以下是cyvcf2常用的操作汇总,涵盖加载文件、解析变异、访问基因型、筛选变异、修改文件等核心功能,附带简洁的代码示例。内容按功能模块组织,力求简明实用,方便快速参考。假设用户已熟悉cyvcf2的基本背景(如VCF/BCF文件解析),本文直接聚焦操作。1.加载VCF/BCF文件基本加载:打开VCF或BCF文件,支持.vcf、.vcf.gz和.bcf格式。fromcyvcf2importVCFvcf
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在生物信息学分析中,处理VCF(VariantCallFormat)文件的Python包有很多,以下是一些常用且好用的Python包,适合不同的分析需求:PyVCF(推荐)简介:PyVCF是一个专门为解析和操作VCF文件设计的Python库,支持读取、过滤和修改VCF文件。优点:简单易用,API直观。支持VCF4.0及以上版本。可以轻松访问变体的信息(如染色体、位置、参考碱基、变异碱基等)。安装:
- 佰力博科技与您探讨电晕极化和油浴极化有什么区别?
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科技制造材料工程
电晕极化和油浴极化是两种常见的极化方法,广泛应用于压电陶瓷、聚合物薄膜等材料的极化处理中。它们在原理、操作方式、适用材料和优缺点等方面存在显著差异。电晕极化:电晕极化是一种非接触极化方法,通过在高压电场下产生电晕放电,使空气中的电子和离子被加速并注入到材料表面,从而实现材料的极化。这种极化方式依赖于电场的不均匀性,通常需要尖锐的电极(如针状电极)来产生电晕放电。电晕极化过程中,电荷主要通过电晕放电
- 班车服务系统扩展到多场景(穿梭车、周转车)的升级过程中,遗传算法和蚁群算法的实现示例
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班车服务系统扩展到多场景(如办公场地穿梭车、周转车)的升级过程中,遗传算法(GA)和蚁群算法(ACO)实现协同优化,代码示例如下:一、算法选择与场景适配1.遗传算法:全局调度优化适用场景:多车辆类型(班车、穿梭车、周转车)的协同调度、时间窗约束(如会议通勤时间)、资源分配(如车辆容量限制)。核心逻辑:通过染色体编码表示调度方案,利用选择、交叉、变异操作生成新解,逐步逼近最优调度序列。Java代码示
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一、首先,我们先弄清楚数据表中的数据是怎么分布的数据分布建表时,您需要通过设置分区和分桶,指定数据分布方式,并且建议您合理设置分区和分桶,实现数据均匀的分布。数据分布是指数据划分为子集,并按一定规则均衡地分布在不同节点上,能够有效裁剪数据扫描量,最大限度地利用集群的并发性能,从而提升查询性能。数据分布概览常见的数据分布方式现代分布式数据库中,常见的数据分布方式有如下四种:Round-Robin、R
- Vue 2 和 Vue 3 区别
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- Kafka 数据倾斜原因、影响与权威解决方案
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- kafka如何让消息均匀的写入到每个partition
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- 八、提升服务高可用性
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引言隧道爆破施工是现代工程建设中常用的方法,但爆破产生的振动会对周围结构和地质环境产生影响。本文介绍一个基于Python的邻近巷道爆破振动模拟系统,该系统通过数值计算模拟爆破引起的应力波传播过程,并提供多种可视化方式展示振动效应。本研究对于理解爆破振动机理、评估爆破安全距离以及优化爆破参数具有重要意义。理论基础爆破应力波传播模型爆破引起的应力波在岩体中的传播可通过弹性波动理论描述。在均匀介质中,应
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文章目录前言一、遗传算法介绍二、遗传算法算子1.种群初始化1.1二进制数编码1.2浮点数编码1.3小结2.选择算子3.交叉算子4.变异算子5.小结三、算法实例1.例一2.例二3.例三4.小结四、算法函数封装1.示例一2.示例二3.示例三五、参考文献前言遗传算法(GA)作为求解单目标优化问题的有效算法,自提出以来,便被广泛采用。该算法主要是模仿达尔文进化论,通过种群不断的进行自然选择、繁衍交叉变异,
- 遗传算法:原理、实现与应用的全面解析
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摘要本文深入探讨遗传算法这一模拟自然进化过程的计算模型,详细阐述其核心原理、关键步骤、实现方式及在多领域的应用。通过分析遗传算法与传统优化算法的差异,结合实际案例展示其在解决复杂优化问题上的优势,并探讨算法的改进策略与未来发展趋势,旨在为相关领域研究和实践提供全面理论支撑与实践指导,助力解决复杂优化难题,推动技术创新与发展。一、引言在现代科学与工程领域,诸多问题可归结为优化问题,如资源分配、路径规
- 遗传算法的原理与实现示例
遗传算法是一种受生物进化理论启发的随机优化算法,其核心思想是模拟自然界中“物竞天择、适者生存”的进化过程,通过对候选解的迭代优化,找到问题的最优解。一、核心思想 遗传算法将优化问题的候选解视为生物群体中的“个体”,每个个体的“基因”对应解的参数。通过模拟生物进化中的选择、交叉、变异等过程,让群体中“适应性强”(即更接近最优解)的个体保留并繁衍,“适应性弱”的个体被淘汰,最终使群体逐渐逼近最优
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- AutoMedPrompt的技术,自动优化提示词
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AutoMedPrompt的技术,自动优化提示词让大语言模型在医学答题方面的表现大幅提升,甚至能让开源模型在某些医学数据集上超过GPT-4等商业模型。AutoMedPrompt原理深度解析与实例说明一、核心原理:文本梯度驱动的提示词优化1.传统提示工程的痛点手动设计提示词依赖专家经验,难以覆盖医学领域的复杂性(如不同专科考点、病例变异)。固定提示词(如CoT思维链)无法动态适应具体问题,可能引入无
- 点云从入门到精通技术详解100篇-基于二维激光雷达的隧道形貌三维重建(续)
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目录3.4点云数据精简3.4.1数据精简的要求3.4.2经典精简算法分析3.5点云三维重建算法3.5.1曲面重建方式的分类3.5.2点云数据的三角剖分3.5.3Delaunay三角剖分算法3.5.4贪婪投影三角化算法3.5.5泊松曲面重建算法4特征保留优化的点云精简4.1引言4.2点云精简的思想4.3基于图信号的特征保留优化的点云精简算法4.3.2定义密度均匀性损失4.4点云精简实验结果及分析5隧
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分析工具空间变化属性变化Union合并打断后保留所有面与合并要素相交的部分,在原属性上增加合并要素属性Intersect相交打断后保留公共部分新增相交要素的属性SymmetricalDifference均匀插值打断后保留非公共部分原属性(新增字段)Identity标记打断后保留输入要素部分与标记要素相交的部分,在原属性上增加标记要素属性Erase擦除打断后保留输入要素的子集(与擦除要素的非公共部分
- DeepMind 发布 AlphaGenome,1 秒内完成所有模态和细胞类型的变异效应预测
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谷歌DeepMind的Alpha系列再添新成员——AlphaGenome,其能够更全面、准确地预测人类DNA序列中单个变异或突变,如何影响一系列调控基因的生物过程。AlphaGenome模型以长达100万个碱基对的DNA序列为输入,预测数千种与其调控活性相关的分子属性,同时还可以通过比较变异与未变异序列的预测结果,评估基因变异或突变的影响。该模型建立在DeepMind此前的基因组模型Enforme
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研究的目的是证明一种有限元相场算法,其中相场方程是完全耦合并同时求解的。不过,在这种情况下,完全耦合的方程是弹性和非守恒的阶参数;然而,该方法可作为其他相场模型完全耦合公式的模板。这是求解具有弹性不均匀性的Allen-Cohn方程的主要程序。有限元算法。该算法解决了非保守阶参数的演化问题。全耦合模式下应力列场的演化。取决于代码中Isolve参数的选择:对于Isolve-1,代码以长手格式和非优化模
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结构力学优化算法:多目标优化:遗传算法与结构优化绪论结构优化的重要性在工程设计中,结构优化扮演着至关重要的角色。它旨在通过最小化成本、重量或应力等目标,同时确保结构的强度、刚度和稳定性满足设计要求,来提高结构的性能和效率。结构优化可以帮助工程师在设计初期就避免潜在的结构问题,减少材料浪费,降低生产成本,同时提升产品的竞争力。多目标优化的概念多目标优化是指在优化过程中同时考虑多个目标函数的优化问题。
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目录Python实例题题目要求:解题思路:代码实现:Python实例题题目基于遗传算法的旅行商问题求解要求:使用遗传算法解决旅行商问题(TSP)。支持以下功能:随机生成城市坐标或导入预定义城市实现遗传算法的基本操作(选择、交叉、变异)可视化进化过程和最终路径统计进化过程中的适应度变化允许用户调整遗传算法参数(种群大小、迭代次数、交叉率、变异率等)。解题思路:用列表表示城市访问顺序作为染色体。使用欧
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Ribbon作为SpringCloud生态中的客户端负载均衡工具,提供多种动态负载均衡算法,根据后端服务状态智能分配请求。其核心算法及适用场景如下:一、Ribbon负载均衡算法算法名称工作原理引用来源轮询(RoundRobinRule)按服务列表顺序依次分发请求,实现均匀分摊负载随机(RandomRule)从可用服务列表中随机选择一个实例处理请求加权响应时间(WeightedResponseTim
- AI助力基因数据分析:用Python玩转生命密码的秘密
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AI助力基因数据分析:用Python玩转生命密码的秘密说到基因数据,听起来是不是感觉有点高大上?其实,基因数据分析正变得越来越“接地气”,而AI正是这条路上的神奇钥匙。今天,咱们就用Python聊聊如何利用AI技术做基因数据分析与建模,帮你破解生命的密码,找到疾病预测、个性化医疗的新路子。一、基因数据为何如此特别?基因组测序技术让我们能够获取人体细胞内数以百万计的DNA序列变异信息。但数据量巨大、
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dockerredis容器
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Spring分布式架构常用组件及其业务场景案例:####服务注册与发现-Eureka-Nacos-服务消费者通过注册中心动态发现可用的服务提供者,实现服务间的解耦和动态调用。####负载均衡-Ribbon-LoadBalancer-在客户端进行负载均衡,将请求均匀分发到各个实例,提升系统的吞吐量和响应速度。####服务间调用-OpenFeign**业务场景**:-通过OpenFeign定义接口和注
- TI SAR ADC
,这里简单介绍下TISAR原理及相关技术时域交织ADC通过并行多个子ADC,使其依次对输入进行采样、转换、输出的一种高速ADC结构。这种类型ADC的采样率可以达到子ADC的M倍,M是通道数,同时又具有子ADC的精度及特点。M通道时域交织ADC基本原理图如上图所示。子ADC采样率为fs/M,其中fs是时域交织ADC采样率。各子ADC采样时钟均匀分布,依次按相位延迟1/fs完成各自转换后再通过选择器(
- 一套基于粒子群优化(PSO)算法的天线波束扫描MATLAB实现方案
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MATLAB深度学习算法算法matlab人工智能制造开发语言分类
以下是一套基于粒子群优化(PSO)算法的天线波束扫描MATLAB实现方案,包含完整代码、数学原理和详细注释。该方案针对均匀线性阵列(ULA)的波束方向图优化,通过调整阵元相位实现主瓣指向目标方向并抑制旁瓣。%%天线波束扫描的PSO算法实现%作者:DeepSeek%创建日期:2025-06-21%功能:使用PSO优化均匀线性阵列的相位分布,实现波束扫描和旁瓣抑制clc;clear;closeall;
- PHP,安卓,UI,java,linux视频教程合集
cocos2d-x小菜
javaUIlinuxPHPandroid
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- zookeeper admin 笔记
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zookeeper
Required Software
1) JDK>=1.6
2)推荐使用ensemble的ZooKeeper(至少3台),并run on separate machines
3)在Yahoo!,zk配置在特定的RHEL boxes里,2个cpu,2G内存,80G硬盘
数据和日志目录
1)数据目录里的文件是zk节点的持久化备份,包括快照和事务日
- Spring配置多个连接池
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项目中需要同时连接多个数据库的时候,如何才能在需要用到哪个数据库就连接哪个数据库呢?
Spring中有关于dataSource的配置:
<bean id="dataSource" class="com.mchange.v2.c3p0.ComboPooledDataSource"
&nb
- Mysql
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mysql
例如,你想myuser使用mypassword从任何主机连接到mysql服务器的话。
GRANT ALL PRIVILEGES ON *.* TO 'myuser'@'%'IDENTIFIED BY 'mypassword' WI
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如果你想允许用户myuser从ip为192.168.1.6的主机连接到mysql服务器,并使用mypassword作
- CommonDAO(公共/基础DAO)
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DAO
好久没有更新博客了,最近一段时间工作比较忙,所以请见谅,无论你是爱看呢还是爱看呢还是爱看呢,总之或许对你有些帮助。
DAO(Data Access Object)是一个数据访问(顾名思义就是与数据库打交道)接口,DAO一般在业
- 直言有讳
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1.转载地址:http://blog.csdn.net/jasonblog/article/details/10813313
精华:
“直言有讳”是阿里巴巴提倡的一种观念,而我在此之前并没有很深刻的认识。为什么呢?就好比是读书时候做阅读理解,我喜欢我自己的解读,并不喜欢老师给的意思。在这里也是。我自己坚持的原则是互相尊重,我觉得阿里巴巴很多价值观其实是基本的做人
- 安装CentOS 7 和Win 7后,Win7 引导丢失
随便小屋
centos
一般安装双系统的顺序是先装Win7,然后在安装CentOS,这样CentOS可以引导WIN 7启动。但安装CentOS7后,却找不到Win7 的引导,稍微修改一点东西即可。
一、首先具有root 的权限。
即进入Terminal后输入命令su,然后输入密码即可
二、利用vim编辑器打开/boot/grub2/grub.cfg文件进行修改
v
- Oracle备份与恢复案例
aijuans
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Oracle备份与恢复案例
一. 理解什么是数据库恢复当我们使用一个数据库时,总希望数据库的内容是可靠的、正确的,但由于计算机系统的故障(硬件故障、软件故障、网络故障、进程故障和系统故障)影响数据库系统的操作,影响数据库中数据的正确性,甚至破坏数据库,使数据库中全部或部分数据丢失。因此当发生上述故障后,希望能重构这个完整的数据库,该处理称为数据库恢复。恢复过程大致可以分为复原(Restore)与
- JavaEE开源快速开发平台G4Studio v5.0发布
無為子
我非常高兴地宣布,今天我们最新的JavaEE开源快速开发平台G4Studio_V5.0版本已经正式发布。
访问G4Studio网站
http://www.g4it.org
2013-04-06 发布G4Studio_V5.0版本
功能新增
(1). 新增了调用Oracle存储过程返回游标,并将游标映射为Java List集合对象的标
- Oracle显示根据高考分数模拟录取
百合不是茶
PL/SQL编程oracle例子模拟高考录取学习交流
题目要求:
1,创建student表和result表
2,pl/sql对学生的成绩数据进行处理
3,处理的逻辑是根据每门专业课的最低分线和总分的最低分数线自动的将录取和落选
1,创建student表,和result表
学生信息表;
create table student(
student_id number primary key,--学生id
- 优秀的领导与差劲的领导
bijian1013
领导管理团队
责任
优秀的领导:优秀的领导总是对他所负责的项目担负起责任。如果项目不幸失败了,那么他知道该受责备的人是他自己,并且敢于承认错误。
差劲的领导:差劲的领导觉得这不是他的问题,因此他会想方设法证明是他的团队不行,或是将责任归咎于团队中他不喜欢的那几个成员身上。
努力工作
优秀的领导:团队领导应该是团队成员的榜样。至少,他应该与团队中的其他成员一样努力工作。这仅仅因为他
- js函数在浏览器下的兼容
Bill_chen
jquery浏览器IEDWRext
做前端开发的工程师,少不了要用FF进行测试,纯js函数在不同浏览器下,名称也可能不同。对于IE6和FF,取得下一结点的函数就不尽相同:
IE6:node.nextSibling,对于FF是不能识别的;
FF:node.nextElementSibling,对于IE是不能识别的;
兼容解决方式:var Div = node.nextSibl
- 【JVM四】老年代垃圾回收:吞吐量垃圾收集器(Throughput GC)
bit1129
垃圾回收
吞吐量与用户线程暂停时间
衡量垃圾回收算法优劣的指标有两个:
吞吐量越高,则算法越好
暂停时间越短,则算法越好
首先说明吞吐量和暂停时间的含义。
垃圾回收时,JVM会启动几个特定的GC线程来完成垃圾回收的任务,这些GC线程与应用的用户线程产生竞争关系,共同竞争处理器资源以及CPU的执行时间。GC线程不会对用户带来的任何价值,因此,好的GC应该占
- J2EE监听器和过滤器基础
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J2EE
Servlet程序由Servlet,Filter和Listener组成,其中监听器用来监听Servlet容器上下文。
监听器通常分三类:基于Servlet上下文的ServletContex监听,基于会话的HttpSession监听和基于请求的ServletRequest监听。
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ServletContex又叫application
- 博弈AngularJS讲义(16) - 提供者
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jsAngularJSapiAngularProvider
Angular框架提供了强大的依赖注入机制,这一切都是有注入器(injector)完成. 注入器会自动实例化服务组件和符合Angular API规则的特殊对象,例如控制器,指令,过滤器动画等。
那注入器怎么知道如何去创建这些特殊的对象呢? Angular提供了5种方式让注入器创建对象,其中最基础的方式就是提供者(provider), 其余四种方式(Value, Fac
- java-写一函数f(a,b),它带有两个字符串参数并返回一串字符,该字符串只包含在两个串中都有的并按照在a中的顺序。
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public class CommonSubSequence {
/**
* 题目:写一函数f(a,b),它带有两个字符串参数并返回一串字符,该字符串只包含在两个串中都有的并按照在a中的顺序。
* 写一个版本算法复杂度O(N^2)和一个O(N) 。
*
* O(N^2):对于a中的每个字符,遍历b中的每个字符,如果相同,则拷贝到新字符串中。
* O(
- sqlserver 2000 无法验证产品密钥
Chen.H
sqlwindowsSQL ServerMicrosoft
在 Service Pack 4 (SP 4), 是运行 Microsoft Windows Server 2003、 Microsoft Windows Storage Server 2003 或 Microsoft Windows 2000 服务器上您尝试安装 Microsoft SQL Server 2000 通过卷许可协议 (VLA) 媒体。 这样做, 收到以下错误信息CD KEY的 SQ
- [新概念武器]气象战争
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气象战争的发动者必须是拥有发射深空航天器能力的国家或者组织....
原因如下:
地球上的气候变化和大气层中的云层涡旋场有密切的关系,而维持一个在大气层某个层次
- oracle 中 rollup、cube、grouping 使用详解
daizj
oraclegroupingrollupcube
oracle 中 rollup、cube、grouping 使用详解 -- 使用oracle 样例表演示 转自namesliu
-- 使用oracle 的样列库,演示 rollup, cube, grouping 的用法与使用场景
--- ROLLUP , 为了理解分组的成员数量,我增加了 分组的计数 COUNT(SAL)
- 技术资料汇总分享
Dead_knight
技术资料汇总 分享
本人汇总的技术资料,分享出来,希望对大家有用。
http://pan.baidu.com/s/1jGr56uE
资料主要包含:
Workflow->工作流相关理论、框架(OSWorkflow、JBPM、Activiti、fireflow...)
Security->java安全相关资料(SSL、SSO、SpringSecurity、Shiro、JAAS...)
Ser
- 初一下学期难记忆单词背诵第一课
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could 能够
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Tuesday 星期二
February 二月
eighteenth 第十八
listen 听
careful 小心的,仔细的
short 短的
heavy 重的
empty 空的
certainly 当然
carry 携带;搬运
tape 磁带
basket 蓝子
bottle 瓶
juice 汁,果汁
head 头;头部
- 截取视图的图片, 然后分享出去
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OSObjective-C
OS 7 has a new method that allows you to draw a view hierarchy into the current graphics context. This can be used to get an UIImage very fast.
I implemented a category method on UIView to get the vi
- MySql重置密码
fanxiaolong
MySql重置密码
方法一:
在my.ini的[mysqld]字段加入:
skip-grant-tables
重启mysql服务,这时的mysql不需要密码即可登录数据库
然后进入mysql
mysql>use mysql;
mysql>更新 user set password=password('新密码') WHERE User='root';
mysq
- Ehcache(03)——Ehcache中储存缓存的方式
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ehcacheMemoryStoreDiskStore存储驱除策略
Ehcache中储存缓存的方式
目录
1 堆内存(MemoryStore)
1.1 指定可用内存
1.2 驱除策略
1.3 元素过期
2 &nbs
- spring mvc中的@propertysource
jackyrong
spring mvc
在spring mvc中,在配置文件中的东西,可以在java代码中通过注解进行读取了:
@PropertySource 在spring 3.1中开始引入
比如有配置文件
config.properties
mongodb.url=1.2.3.4
mongodb.db=hello
则代码中
@PropertySource(&
- 重学单例模式
lanqiu17
单例Singleton模式
最近在重新学习设计模式,感觉对模式理解更加深刻。觉得有必要记下来。
第一个学的就是单例模式,单例模式估计是最好理解的模式了。它的作用就是防止外部创建实例,保证只有一个实例。
单例模式的常用实现方式有两种,就人们熟知的饱汉式与饥汉式,具体就不多说了。这里说下其他的实现方式
静态内部类方式:
package test.pattern.singleton.statics;
publ
- .NET开源核心运行时,且行且珍惜
netcome
java.net开源
背景
2014年11月12日,ASP.NET之父、微软云计算与企业级产品工程部执行副总裁Scott Guthrie,在Connect全球开发者在线会议上宣布,微软将开源全部.NET核心运行时,并将.NET 扩展为可在 Linux 和 Mac OS 平台上运行。.NET核心运行时将基于MIT开源许可协议发布,其中将包括执行.NET代码所需的一切项目——CLR、JIT编译器、垃圾收集器(GC)和核心
- 使用oscahe缓存技术减少与数据库的频繁交互
Everyday都不同
Web高并发oscahe缓存
此前一直不知道缓存的具体实现,只知道是把数据存储在内存中,以便下次直接从内存中读取。对于缓存的使用也没有概念,觉得缓存技术是一个比较”神秘陌生“的领域。但最近要用到缓存技术,发现还是很有必要一探究竟的。
缓存技术使用背景:一般来说,对于web项目,如果我们要什么数据直接jdbc查库好了,但是在遇到高并发的情形下,不可能每一次都是去查数据库,因为这样在高并发的情形下显得不太合理——
- Spring+Mybatis 手动控制事务
toknowme
mybatis
@Override
public boolean testDelete(String jobCode) throws Exception {
boolean flag = false;
&nbs
- 菜鸟级的android程序员面试时候需要掌握的知识点
xp9802
android
熟悉Android开发架构和API调用
掌握APP适应不同型号手机屏幕开发技巧
熟悉Android下的数据存储
熟练Android Debug Bridge Tool
熟练Eclipse/ADT及相关工具
熟悉Android框架原理及Activity生命周期
熟练进行Android UI布局
熟练使用SQLite数据库;
熟悉Android下网络通信机制,S