R语言系列：非参数检验

1、单样本和两样本的秩和检验
单样本和配对样本检验采用Wilcoxon符号秩检验，两独立样本检验采用Wilcoxon秩和检验（和Mann-Whitney检验等效）。
wilcox.test(x, y = NULL,
    alternative = c("two.sided", "less", "greater"),     #默认双侧检验
    mu = 0,     #单样本检验时，mu为已知总体的中心位置；两样本检验时，为总体之差的中心位置
    paired = FALSE,     #定义是否配对检验
    exact = NULL, correct = TRUE,     #默认样本含量低于50且没有结时，计算精确p值，否则连续性校正
    conf.int = FALSE, conf.level = 0.95)    #是否输出可信区间及其置信水平
例：
x=rnorm(100, 175, 5); wilcox.test(x, mu=180);     #单样本检验
y=rnorm(100, 180, 10); wilcox.test(x, y, paired=TRUE);    #配对样本检验
wilcox.test(x, y);    #两独立样本检验

2、多样本的Kruskal-Wallis秩和检验
kruskal.test(x)    #x是一个列表(！)，可使用list(x1, x2, ...)将若干变量包进来

3、频数行列表的检验
chisq.test(x)    #x是一个矩阵，默认对四格表进行连续性校正
fisher.test(x)    #x是一个矩阵，计算确切概率，用于大样本会非常消耗资源

附：
1、可用p.adjust对多重比较的P值进行校正
2、stats包里有几个pairwise.*函数也可用于多重校正，当前包括四个函数：
    pairwise.prop.test
    pairwise.t.test
    pairwise.table
    pairwise.wilcox.test