编辑距离

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    脱氧核糖核酸即常说的DNA，是一类带有遗传信息的生物大分子。它由4种主要的脱氧核苷酸(dAMP、dGMP、dCMT和dTMP)通过磷酸二酯键连接而成。这4种核苷酸可以分别记为：A、G、C、T。

    DNA携带的遗传信息可以用形如：AGGTCGACTCCA.... 的串来表示。DNA在转录复制的过程中可能会发生随机的偏差，这才最终造就了生物的多样性。

    为了简化问题，我们假设，DNA在复制的时候可能出现的偏差是（理论上，对每个碱基被复制时，都可能出现偏差）：

　　1. 漏掉某个脱氧核苷酸。例如把 AGGT 复制成为：AGT

    2. 错码，例如把 AGGT 复制成了：AGCT

    3. 重码，例如把 AGGT 复制成了：AAGGT

    如果某DNA串a，最少要经过 n 次出错，才能变为DNA串b，则称这两个DNA串的距离为 n。

    例如：AGGTCATATTCC 与 CGGTCATATTC 的距离为 2

    你的任务是：编写程序，找到两个DNA串的距离。

【输入、输出格式要求】

    用户先输入整数n(n<100)，表示接下来有2n行数据。

    接下来输入的2n行每2行表示一组要比对的DNA。（每行数据长度<10000）

    程序则输出n行，表示这n组DNA的距离。

    例如：用户输入：
3
AGCTAAGGCCTT
AGCTAAGGCCT
AGCTAAGGCCTT
AGGCTAAGGCCTT
AGCTAAGGCCTT
AGCTTAAGGCTT

    则程序应输出：
1
1
2

结题思路：参阅百度百科http://baike.baidu.com/view/2020247.htm
代码如下：

import  java.util. * ;


public   class  Main  {
    
    
    static String instr0;
    static String instr1;
    public static void main(String[] args)
    {
        Scanner sc = new Scanner(System.in);
        int N = sc.nextInt();
        sc.nextLine();
        for(int ii = 0; ii < N; ii++){
            instr0 = sc.nextLine();
            instr1 = sc.nextLine();
            int rs = pro();
            System.out.println(rs);
        }
        
    }
    static int pro(){
        int[][] dis = new int[instr0.length()][instr1.length()];
        for(int i = 0; i < instr0.length(); i++)
            dis[i][0] = i;
        for(int j = 0; j < instr1.length(); j++)
            dis[0][j] = j;
        for(int i = 1; i < instr0.length(); i++){
            for(int j = 1; j < instr1.length(); j++){
                int cost = 0;
                if(instr0.charAt(i) != instr1.charAt(j))
                    cost = 1;
                dis[i][j] = min3(dis[i - 1][j] + 1, dis[i][j - 1] + 1, 
                        dis[i - 1][j - 1] + cost);
            }
        }
        return dis[instr0.length() - 1][instr1.length() - 1];
        
    }
    static int min3(int a, int b, int c){
        return Math.min(Math.min(a, b), c);
    }

    
}