医学开源配准软件Elastix手册（中文翻译）——第五章 指南（配准组件、配准参数）

5.1 选择配准组件

在执行配准时，你需要选择一些组件，详见第二章。

这些组件需要写入参数文件中，例如：

(Transform"BSplineTransform")

(Metric"AdvancedMattesMutualInformation")

表5.1给出了一些必要的组件及其建议。第二章没有讲配准组件。配准组件用来连接所有其他组件，实现多分辨率的配准。因此有人说他很好的完成了图2.2的任务。同时，第二章也没有明确提出重采样组件。它只是在配准后用来生成浮动图像的变换。目前，elastix中只有一种可用的重采样：the DefaultResampler，这将不会详细讨论。

Component                      Recommendation

Registration                MultiResolutionRegistration

Metric                     AdvancedMattesMutualInformation

Sampler                   RandomCoordinate

Interpolator                BSplineInterpolator

ResampleInterpolator       FinalBSplineInterpolator

Resampler                 DefaultResampler

Transform                 Depends on theapplication

Optimizer                 AdaptiveStochasticGradientDescent

FixedImagePyramid         FixedSmoothingImagePyramid

MovingImagePyramid       MovingSmoothingImagePyramid

 

5.2 概述所有参数

http://elastix.isi.uu.nl/doxygen/modules.html     列出了elastix的可用组件。

http://elastix.isi.uu.nl/doxygen/parameter.html   列出了每个配准组件的参数。

在这个网页上你可以找到怎样指定一个参数以及它的默认值是什么。我们已经试图想出合理的默认值，但是默认值不是在任何情况下都有用。在viki上你可以找到一系列可用的参数文件：http://elastix.bigr.nl/wiki/index.php/Parameter_file_database  这样你就可以开始以的程序了。

5.3重要的参数

这一块比较多，而且重要，放在下一篇博文。