Broad

2023-04-07

重测序分析-使用GATK进行SNP和INDEL检测GATK是Broad开发的用于二代测序数据变异检测的软件，后续推广到动植物研究中，是目前最广泛使用的变异检测软件。
小谷头·2024-02-05 00:49

把ICDAR2019-LSVT原始数据集转为REC任务识别数据

ICDAR2019-LSVT数据集有两个：①BaiduResearchOpen-AccessDataset-Introductionhttps://ai.baidu.com/broad/introduction
訢詡·2024-01-23 21:30

关于sentieon的几点补充说明

准Broad研究所的GATK目前仍然是call变异软件中被业界认可度最高的，而sentieon是用的和GATK一样的数学模型，不一样的是对算法进行了改进，用sentieon的结果和GATK一样。
六六_ryx·2024-01-22 16:45

IO网络编程Day4

==-1){perror("socketerror");return-1;}//2、将套接字设置成允许广播intbroadcast=1;if(setsockopt(sfd,SOL_SOCKET,SO_BROAD
yxgjbfddgijhhhj·2024-01-22 10:21

Pytorch之目标检测（单个目标检测，Single Object Detection）

数据集下载地址AMD-Training400.ziphttps://ai.baidu.com/broad/introduction引入包%matplotlibinlineimportmatplotlib.pyplotaspltimportseabornassnsfromPILimportImage
深思海数_willschang·2024-01-19 03:51

Linux 解析命令行参数

1);classArgs{public:Args():body("msgbodyfortest"),thread_count(std::thread::hardware_concurrency()),broad
_虚竹·2024-01-19 03:24

BCT642BROAD CHIP 高速 MIPI 开关 代理商方案

BCT642Low-Power,Three-Port，High-SpeedMIPI交换机一般描述特性BCT642是一款bi-directional,low-power,high-低通电容:7.0pF典型快速模拟开关。引脚输出被设计为·低导通电阻：7.0典型简化差分信号布局,配置为差分3db带宽:1.5GHz一种三极双掷开关（TPDT）.24引线QFN(2.5x3.4mm)BCT642针对两个MIP
禾川兴科技·2023-12-23 07:03

用Mood Broad策划校园清新风拍摄

东风拂面，草绿花开，又是一年拍照的好时节。在生机盎然的校园里，拍一组青春洋溢的写真，是个不错的选择。依据摄影策划MoodBroad（情绪版），进行策划如下。1.环境当然是在校园了，可以选择教室、运动场、楼梯、走廊等场所。重走一遍那些留下最多回忆的地方，与美好的回忆合影！教室。课室是留下最多回忆的地方之一了，黑板再擦一次，课室再坐一次。楼梯。在楼梯的转角处，你与青春撞了个满怀。每次上下课必经的一级一
张永胜_永往直前·2023-12-22 06:21

8、BroadcastReceiver 与 LocalBroadcastReceiver 有什么区别？

BroadcastReceiver使用1.制作intent（可以携带参数）2.使用sendBroadcast()传入intent;3.制作广播接收器类继承Broad
五道杠小学生·2023-12-14 22:23

服务器安装esxi虚拟机,在 Dell R720 服务器上安装 VMware ESXi 5 之经验总结

经过检查后发现原来是VMwareESXi5.0官方光盘中内置的Broad
诺唯·2023-11-22 20:31

OSPF→

链路类型广播多路访问型（Broad
bitbot·2023-11-19 03:27

分享经典 A STUDY IN SCARLET

Chapter1Mr.SherlockHolmesThiswasaloftychamber,linedandlitteredwithcountlessbottles.Broad,lowtableswerescatteeredabout
绿豆芽翠·2023-11-05 15:26

每日一词-11.2-appeal

ADJ.considerable,great,growing,obvious,powerful,special,strong|immediate,instant|limited,little|broad
晓航航·2023-10-28 04:25

msigdbr hallmarks gsea broad研究所

使用msigdbrr包#BiocManager::install("msigdb")#https://www.gsea-msigdb.org/gsea/msigdb#https://cran.r-project.org/web/packages/msigdbr/vignettes/msigdbr-intro.html#https://bioconductor.org/packages/releas
生信小博士·2023-10-27 10:40

[②ADRV902x]: 参考设计软件

软件包名称为adrv9029-customerpkg-broad-market-release，解压缩后包含下面几个文件夹：ADRV9025作为ADRV902x系列的通用名称代表，在Adi.Adrv902
李71~李先森·2023-10-26 02:41

英语流利说笔记2018-12-20

brandishv.towavesomethingaroundinadangerousorthreateningway,especiallyaweapon挥舞~akitchenknife.brim1.n.帽檐；（容器的）口broad-brimmed
L栩栩·2023-10-25 15:11

Scrapy框架--通用爬虫Broad Crawls（上）

通用爬虫(BroadCrawls)介绍[传送：中文文档介绍]，里面除了介绍还有很多配置选项。通用爬虫一般有以下通用特性:其爬取大量(一般来说是无限)的网站而不是特定的一些网站。其不会将整个网站都爬取完毕，因为这十分不实际(或者说是不可能)完成的。相反，其会限制爬取的时间及数量。其在逻辑上十分简单(相较于具有很多提取规则的复杂的spider)，数据会在另外的阶段进行后处理(post-processe
中乘风·2023-10-17 10:48

BroadcastChannel-[跨页面传值]

参考发布/订阅模式，基于Broad
是席木木啊·2023-10-14 10:15

导航栏总结

组件数据获取和渲染组件数据获取目前项目broad
Summerdise·2023-10-12 17:24

单细胞转录组高级分析四：scRNA数据推断CNV

inferCNV简介inferCNV是大名鼎鼎的broad研究所开发的，可以使用单细胞转录组数据分析肿瘤细胞CNV。
Seurat_Satija·2023-09-20 13:17

2022-11-17

NatBiotech|可编程真核蛋白合成,利用ADAR的RNA传感器原创图灵基因图灵基因2022-11-1710:11发表于江苏收录于合集#前沿分子生物学技术511个麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所和麻省理工学院
图灵基因·2023-09-11 20:46

布洛德博物馆 (The Broad)

TheBroadmuseum,onGrandAvenueinDowntownLosAngeles|PhotobyIwanBaan,courtesyofTheBroadandDillerScofidio+Renfro随着位于市中心格兰德大街(GrandAvenue)的布洛德博物馆(TheBroad)于2015年9月20日正式开放，这个壮观的洛杉矶当代艺术博物馆终于揭开了神秘的面纱。这座由慈善家Eli
学不知·2023-09-05 01:54

Slide-tags

Slide-tags：可扩展的、用于多模态空间基因组学的单核条形码技术)Affiliation:BroadInstituteofHarvardandMIT,Cambridge,MA,USA(哈佛大学和麻省理工学院的Broad
阿May ♬·2023-08-23 16:01

机器学习笔记 - 基于PyTorch + 类似ResNet的单目标检测

BaiduResearchOpen-AccessDataset-DownloadDownloadBaiduResearchOpen-AccessDatasethttps://ai.baidu.com/broad
坐望云起·2023-08-13 06:21

小鼠基因集-GSKB--R进行GSEA富集分析

通过查询，最终发育有一个小鼠的专门数据集，既GSKB，这是鼎鼎大名的broad研究所开发的数据集，而且这个数据集一共7个数据集，主要介绍如下：GSKB的
尧小飞·2023-08-10 20:37

BroadcastReceiver(二)

没有注册广播地址的Broad
爱编程的小火柴·2023-07-29 10:56

2022-05-13 碱基质量重校正时遇到的gatk-bundle下载vcf文件问题

一、问题在按照GATK流程做碱基质量重校正时，需要用到gatk-bundle中下载的一些已知位点vcf文件，如：resources_broad_hg38_v0_Homo_sapiens_assembly38
O_467a·2023-06-07 01:51

InferCNV推断肿瘤细胞CNV及计算细胞CNV score

InferCNV是broad出品的一款对单细胞转录组测序数据推断CNV的工具包。这里我们对其自带的数据运行该工具包看一下效果。
夜凉如水中·2023-04-19 16:37

Broad Institute视频笔记 Introduction to Variant Discovery

本篇笔记是这个系列视频的第4个视频，我没有把所有的视频PPT放上面，因为有些PPT内容很空洞，所以只记录了其中一些。有兴趣的同学可以观看英文原版视频：here上一个视频里讲了数据的预处理过程，完成了预处理后，我们拿到手的bam文件里有了重新校准的碱基质量、标记了duplicates，这时就可以准备callvariants了。这个视频里我们主要是介绍call几种不同的variants。再介绍一下va
生信start_site·2023-04-18 08:42

小鼠基因集-GSKB--R进行GSEA富集分析

通过查询，最终发育有一个小鼠的专门数据集，既GSKB，这是鼎鼎大名的broad研究所开发的数据集，而且这个数据集一共7个数据集，主要介绍如下：imageGSKB数据基因集来源
Seurat_Satija·2023-04-15 15:54

什么是可遗传性(度)?

2.难道还有”broad-senseheritability"(我理解为广义遗传度)于是谷歌了一下，发现确实存在"narrow-sense"和"broad-sens
Bio_zouxudong·2023-04-09 03:48

Android应用程序结构及运行原理

drawable与音乐文件夹res/raw使用扩展.jar包文件夹libs工程配置清单文件AndroidManifest.xmlAndroid应用程序的基本组成Activity组件与视图ViewService组件Broad
kk爱闹·2023-04-07 15:22

Android8.0发送广播注意事项

广播接收器使用的是静态注册发送广播的代码Intentintent=newIntent("com.test.broadcast.Broad.B");sendBroadcast(intent);在Android8.0
acaixuediannao·2023-04-06 20:17

读书笔记-增量学习-A CNN-Based Broad Learning System

一篇2018年关于基于CNN的增量学习论文：ACNN-BasedBroadLearningSystem。对计算机视觉来说，作者提出的CNN-BasedBroadLearningSystem（CNNBLS）比BroadLearningSystem（BLS）更有效。其中用卷积层和最大池化层提取特征，用principalcomponentanalysis（PCA）主成分分析法对特征降维，最后使用Ridg
谷粤狐·2023-04-04 15:08

Broad Institute视频笔记Run Haplotypecaller（WDL+Cromwell）

上一篇笔记里练习了如何使用WDL+Cromwell来打印helloworld。这篇笔记就来练习一下运行GATK的haplotypeCaller，使用GATK团队的示例数据来练习：官方教程：这里视频教程：这里首先打开下载好的hello_gatk.wdl文件看一下脚本：workflowHello_GATK{callHaplotypeCaller_GVCF}taskHaplotypeCaller_GVC
生信start_site·2023-04-04 03:38

易基因 | 单细胞转录组：Smart-seq 2还是10X Genomics Chromium? — 技术解读

但是基于2017年ChristophZiegenhainetal[1]对6种单细胞转录组技术及2019Broad研究所的团队对7种单细胞RNA测序方法进行了比较[2]，某些特殊或者少量细胞样本的单细胞转录组研究中
易基因科技·2023-04-03 18:53

Broad Institute视频笔记Hello World WDL Tutorial

视频地址：这里，这是BroadInstitute团队GATK系列视频的最后一讲，主要是给学生演示如何使用WDL运行任务。WDL的教程，GATK团队在网上发了一个教程：WDLtutorial工作流描述语言(WorkflowDescriptionLanguage,WDL)是一种用可读和可写的语法指定数据处理工作流的方法，由BroadInstitute开发。WDL可以直接将几个复杂的任务串在一起，并行执
生信start_site·2023-04-03 12:50

基因编辑系统Prime Editing的工作原理

2019年10月21日，哈佛大学Broad研究所刘如谦（DavidR.Liu）教授团队在Nature上发表“Search-and-replacegenomeeditingwithoutdouble-strandbreaksordonorDNA
去学习一下啊·2023-04-03 09:10

python关联通达信pywin32_[AHK]联动通达信其实很简单

注意股票代码：沪市代码前加7，其它市场股票代码前面加6.C代码UINTUWM_STOCK=RegisterWindowMessage(_T("Stock"));::PostMessage(HWND_BROAD
weixin_39813200·2023-04-02 03:03

基因型数据填充（imputation）流程知多少

这里强调的是最后一个，broad研究所出口，应该必属精品，有没有兴趣一试呀！了解好原理，使用这些大神的脚本，站在巨人的肩膀上，解决自己的能力短板，也不错，轮子不必总重复造。
zd200572·2023-03-23 04:16

Post-GWAS：LDSC 的 Partitioned Heritability 分析

1下载数据wget-chttps://storage.googleapis.com/broad-alkesgroup-public/LDSCORE/1000G_Phase3_EAS_baseline_v1.2
橙子牛奶糖·2023-03-19 17:01

IGV-基因组浏览器

电脑系统：Ubuntu18.04ItegrativeGenomicsViewer(IGV)是由Broad研究院的研究人员开发的一款功能强大的综合性基因组学可视化工具，此工具可以让从事生物信息的科研工作者轻松的分析查看多种基因组数据
东风008·2023-03-12 15:34

《Android开发进阶：从小工到专家》-第一章：Android 的构成基石——四大组件

BroadcastActivity：负责UI元素的加载与页面之间的跳转Service：负责与UI无关的工作，如在后台执行耗时操作等ContentProvider：负责数据的存储与共享，使得数据可以在多个应用之间共享Broad
夜瑾漠·2023-02-17 08:23

ChIP-seq 分析：教程简介（1）

环境准备IGVIGV可以从BROAD网站安装。》https://
·2023-02-05 22:33

《Lua-in-ConTeXt》08：参数列表解析

例如，将\foo接受的Lua表数据传递给bar函数，\environmentcard-env\startluacodefunctionbar(x)context.startitemize{"n","broad
·2023-02-03 11:00

《Lua-in-ConTeXt》08：参数列表解析

例如，将\foo接受的Lua表数据传递给bar函数，\environmentcard-env\startluacodefunctionbar(x)context.startitemize{"n","broad
·2023-02-01 16:02

Android调用WPS接口打开office类型文件

publicclassWpsModel{publicstaticfinalStringOPEN_MODE="OpenMode";//打开文件的格式publicstaticfinalStringSEND_SAVE_BROAD
程序员王一·2023-01-27 00:21

pytorch读取数据集问题

错误：#size[batch_size,cHeads,centrs,graphsize]dist=torch.sum(torch.abs(points-batch_centroids_broad)**2,4
youyai·2023-01-16 11:23

使用bert4keras进行关系抽取的代码

三元组抽取任务，基于“半指针-半标注”结构文章介绍：https://kexue.fm/archives/7161数据集：http://ai.baidu.com/broad/download?
世界划水锦标赛冠军·2023-01-14 08:00

ATAC-seq分析：教程简介（1）

环境准备IGVIGV可以从BROAD网站安装。》https://www.broadinstitute.org/igv/MACS2MACS2[2]没有R包，但MACS2可在
冷冻工厂·2022-12-29 13:51
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