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最小化构建基于深度学习的原子间势能和力场模型-DeePMD-kit

最小化构建基于深度学习的原子间势能和力场模型-DeePMD-kitDeePMD-kit手册1.关于DeePMD-kit1.1亮点功能2.代码结构3.许可和致谢4.DeepPotential简介5.下载和安装
OverlordDuke·2024-01-14 21:21

lammps python3 shlib_FuzhuLiu

DeePMD-kitManualTableofcontentsAboutDeePMD-kitDeePMD-kitisapackagewritteninPython/C++,designedtominimizetheeffortrequiredtobuilddeeplearningbasedmodelofinteratomicpotentialenergyandforcefieldandtoperf
weixin_39993454·2023-11-25 19:46

跟我学AI建模：分子动力学仿真模拟之DeepMD-kit框架

摘要：分子动力学仿真模拟的重点就在于如何建立模型描述分子间的相互作用。本文分享自华为云社区《AI建模-分子动力学仿真》，作者：木子_007。一、背景分子动力学的仿真模拟广泛应用于医药、化学、生物、材料等领域，研究模拟物质的微观结构，可以帮助我们理解物质的宏观性质，甚至对物质的宏观性质做出预测，物质的微观结构是由原子间的相互作用决定的，所以分子动力学仿真模拟的重点就在于如何建立模型描述分子间的相互作
·2023-06-21 11:49

DeepMD安装及使用笔记（待更新）

1、老板让装一下DeepMD，说是今后会用到，然后我开始再在网上找教程开始装了，完全新手上路。
我的小啾啾·2023-04-10 12:11

linux安装lammps(intel mpi)配合DeePMD-kit

linux安装lammps(intelmpi)配合deepmd2021-03-15ByJunwuChen参考教程：http://t.cn/A6tmS3Aw随着时间的变更，lammps版本提升、编译器更新等原因
ccjjww25·2023-04-10 11:41

Deepmd-lammps在集群上的编译方法（以南方科大的集群为例）

Deepmd是一款高效的神经网络势函数训练软件，只需要有一些Linux和基本的lammps分子动力学基础的使用者即可上手。Deepmd具有很好的lammps接口。
Deepworld·2023-04-10 11:10

离线安装tensorboardx_在Centos下离线安装DeepMD-kit

一周前我们分享了在Ubuntu下在线安装DeepMD-kit，但是有一些服务器或者集群是无法连接外网的，因此很有必要掌握离线安装DeePMD-kit的方法。
weixin_39942488·2023-04-10 11:10

从源码编译安装 TensorFlow C++ 库和 DeepMD-kit

DeepMD简介DeePMD-kit是一个用Python/C++编写的软件包，旨在最大限度地减少构建基于深度学习的原子间势能和力场模型以及执行分子动力学(MD)所需的工作。
MrXun_·2023-04-10 11:40

lammps势函数训练软件：深度势能DeepMD-kit安装方法

本文介绍深度势能（DeepMD）的软件安装方法。lammps模拟必须有势函数支持，如果找不到势函数，模拟将无法继续。
lammps加油站·2023-04-10 11:39

Linux系统安装deepmd可用的源配置

命令：condaconfig--addchannelshttps://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/deepmodeling/linux-64/condaconfig--addchannelshttps://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/deepmodeling/noarch/con
frank_haha·2023-04-10 11:09

deepmd-kit不同描述子的含义

本文译自描述子官方解释，下图所示：deepmd-kit内置了多个descriptor，不同的descriptor的机制有微小差异。
frank_haha·2023-04-10 11:09

【DeePMD-kit】模型计算

DeePMD-kit训练模型的用法在程序包的examples文件夹里多个算例，路径如下：单核运行的话，可以直接执行下面的命令：这里input.json就是输入文件的文件名。
E_Magic_Cube·2023-04-10 11:08

DeePMD-kit 配置环境备忘

版本CondaConda是一个开源的包管理系统和环境管理系统，用于安装多个版本的软件包及其依赖项，并在它们之间轻松切换。它可以在Linux、OSX和Windows上运行，是为Python程序创建的，但可以打包和分发任何软件。condaenactivatecondaactivatedatabasecondacreate-ndatabasepython=3.6condaenvlist/condainf
chen_ ：)·2023-04-10 11:37

性能达1.5+倍！昇腾AI助力分子动力学模拟研究

而深势科技提出的DeePMD-kit可将AI技术成功应用于分子动力学模拟，并实现了上亿原子体系的模拟，目前该项技术已经发展成为端到端的开源解决方案，以科学智能（AIforScience）为分子动力学的行业应用带
昇腾CANN·2022-12-13 16:57

DeepMD-kit和LAMMPS的安装&测试

一、DeepMD-kit、LAMMPS安装1.1docker拉一个镜像此处采用2.3.1cuda使用本机的cuda-11.7dockerpullghcr.io/deepmodeling/deepmd-kit
清榎·2022-07-23 08:30

ASC22 - deePMD-kit

第一次参加ASC比赛，只完成了deePMD-kit初步的优化，记录一个月来的心得与总结IntroductionDeePMD-kit是用Python/c++编写的DeePMD实现，旨在最小化构建基于深度学习的原子间势能和力场模型以及进行分子动力学模拟所需的工作量
chen_ ：)·2022-07-19 16:47

跟我学AI建模：分子动力学仿真模拟之DeepMD-kit框架

摘要：分子动力学仿真模拟的重点就在于如何建立模型描述分子间的相互作用。本文分享自华为云社区《AI建模-分子动力学仿真》，作者：木子_007。一、背景分子动力学的仿真模拟广泛应用于医药、化学、生物、材料等领域，研究模拟物质的微观结构，可以帮助我们理解物质的宏观性质，甚至对物质的宏观性质做出预测，物质的微观结构是由原子间的相互作用决定的，所以分子动力学仿真模拟的重点就在于如何建立模型描述分子间的相互作
·2021-08-05 12:55
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