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Drug-Target
Deep
drug-target
binding affinity prediction with multiple attention blocks论文解读(二)2021SC@SDUSC
2021SC@SDUSC数据集然后是对基准数据集的介绍,KIBA和DAVIS使用CI和r2m度量标准来衡量所提出的模型和基准模型的性能。对于Davis和KIBA数据集中蛋白质和药物的输入,我们采用了DeepDTA方法,通过字典将药物和蛋白质序列的smile数字化到一个固定的最大长度。deepDTAdeepDTA论文笔记:csdn:https://blog.csdn.net/qq_40311018/
芜湖大司码丶
·
2022-11-20 03:04
DTA任务源码分析
深度学习
机器学习
计算机视觉
Deep
drug-target
binding affinity prediction with multiple attention blocks论文解读(一)2021SC@SDUSC
2021SC@SDUSC论文解读:摘要:DTI预测背景:药物靶间相互作用(DTI)预测由于其在药物发现过程中的重要地位而受到越来越多的关注。许多研究引入计算模型,将DTI预测作为回归任务,直接预测药物靶对的结合亲和性。现有研究的缺陷与作者提出的模型:然而,现有的研究在编码药物化合物时忽略了原子之间的本质相关性,仅仅通过连接来模拟药物靶对的相互作用。基于这些观察,在本研究中,我们提出了一个端到端的模
芜湖大司码丶
·
2022-11-20 03:34
DTA任务源码分析
机器学习
深度学习
人工智能
关于
drug-target
interaction
基本概念首先了解一些概念:药物再利用(drugrepurposing):将现有药物转向新的治疗方法;虚拟筛选(virtualscreening):自动筛选潜在的drug-targetpairs,并计算预测的结合分数;对于药物靶标预测(drug-targetinteraction),上面两个任务都能节约时间成本,促进药物发现。深度学习在药物再利用和虚拟筛选方面表现出强大的性能。这两个任务都依赖于一项
tzc_fly
·
2022-10-04 16:52
生物计算工具
Drug-Target
Interaction 预测中的几个数据库
自从YamanishiYet.al.发表论文YamanishiY,ArakiMA,HondaW,etal.Predictionofdrug-targetinteractionnetworksfromtheintegrationofchemicalandgenomicspaces[J].Bioinformatics,2008,24(13):i232-i240.以来,很多论文都基于其发表的四个药靶相互
Y-hit
·
2020-07-01 21:33
Drug-Target
Interaction
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