R语言小记

【R语言】使用ALDEx2对微生物组进行差异分析

代码展示：library(ALDEx2)rm(list=ls())data(selex)selex.sub<-selex[1:400,]selex.sub[1:4,1:4]input<-"Rhizosphere_Time4"#input_list<-c("Rhizosphere_Time0","Rhizosphere_Time1","Rhizosphere_Time2","Rhizosphere_

不是伍壹·2025-03-25 13:15

Elixir语言的学习路线

Elixir语言的学习路线Elixir是一种动态、通用的编程语言，特别适合用于构建可扩展和维护性强的应用程序。它基于Erlang虚拟机（BEAM），因其高并发性和容错能力而广受欢迎。

2401_90032081·2025-03-25 12:09

R语言入门课| 02 R及Rstudio的下载与安装

视频教程先上教程视频，B站同步播出：https://www.bilibili.com/video/BV1miNVeWEkw完整视频回放可见：R语言入门课回放来啦"R语言入门课"是我们认为生信小白入门不得不听的一个课程

Biomamba生信基地·2025-03-24 05:30

R语言基础常用代码总结

基础代码#基础操作ls()#变量列表rm(var.3)cat()#多个输出sink("r_test.txt",split=TRUE)#读写文件分开始与结束#路径操作getwd():获取当前工作目录setwd():设置当前工作目录#基础运算10%/%3#整除<−、=、<<−#左赋值1%in%a#判断元素是否在向量里E%*%t(E)#用于矩阵与它转置的矩阵相乘#数学函数sqrt(n)#n的平方根exp

WhyteHighmore·2025-03-24 05:29

conda安装R语言环境并部署至pycharm

优先看这个：[win10系统使用Pycharm-professional配置R语言-知乎(zhihu.com)](https://zhuanlan.zhihu.com/p/546788455)要安装R4.0.0

楚门留香·2025-03-24 02:02

【R语言2】Introduction to R 基础知识复习小测试 Pop quiz

【R语言】基础知识点Popquiz前言Question1Question2Question3Question4Question5Question6Question7Question8Question9Question10

不二程序猿·2025-03-24 01:20

ARM架构薄记小记1——ARM架构的快速介绍

ARM架构薄记小记1——ARM架构的快速介绍笔者最近正在简单的了解一下ARM架构，特别是ARMCortexA架构的部分，这里，笔者想要薄记的问题有这样一些，也算是简单记录一下自己学习ARM架构的记录。

charlie114514191·2025-03-22 14:05

关于误差平面小记

四维曲面的二维切片：误差平面详解在深度学习优化过程中，我们通常研究损失函数（LossFunction）的变化，试图找到权重的最优配置。由于神经网络的参数空间通常是高维的，我们需要使用低维可视化的方法来理解优化过程和误差平面（ErrorSurface）。在这里，我们讨论一个四维曲面的二维切片，其中：三个维度是网络的权重（w1,w2,w3w_1,w_2,w_3w1,w2,w3）。第四个维度是误差（损失

文弱_书生·2025-03-21 15:43

关于重投影误差小记

重投影误差（ReprojectionError）讲解1.什么是重投影误差？在三维重建或相机标定过程中，我们希望将一个世界坐标系中的三维点投影到相机的图像平面上。理想情况下，该点的投影位置应该与实际图像中的观测点（如特征点）完全匹配，但由于噪声、相机模型的不准确性或优化算法的误差，这两个点可能会有偏差。重投影误差就是这个偏差的度量，即：e=∥pobserved−preprojected∥e=\|p_

文弱_书生·2025-03-21 15:12

关于离子滤波小记

粒子滤波（ParticleFilter,PF）粒子滤波是一种基于蒙特卡洛方法的贝叶斯滤波算法，主要用于解决非线性、非高斯的状态估计问题。它广泛应用于机器人定位、目标跟踪、金融建模等领域。1.粒子滤波的基本概念粒子滤波的核心思想是用一组加权的**随机样本（粒子）**来近似后验概率分布，而非采用卡尔曼滤波那样的参数化分布假设（如高斯分布）。设系统的状态模型如下：xk=f(xk−1,uk,wk)x_k=

文弱_书生·2025-03-21 15:12

Moodle + Websoft9：创新教育的强大组合，助力教学与学习

•学习分析引擎：内置LearningAnalyticsAPI，可集成Python/R语言进行深度学习，预测学生学业风险。•移动优先战略：MoodleApp支持离线学习、扫码签到，2023年新增A

·2025-03-20 14:26

R语言绘图 | 环状柱状图+散点柱状组合图绘制

原文：R语言绘图|环状柱状图+散点柱状组合图绘制(点击访问)小杜的生信筆記，主要发表或收录生物信息学教程，以及基于R分析和可视化（包括数据分析，图形绘制等）；分享感兴趣的文献和学习资料!!

小杜的生信筆記·2025-03-19 12:11

pytorch小记（十二）：pytorch中 masked_fill_() vs. masked_fill() 详解

pytorch小记（十二）：pytorch中masked_fill_（）vs.masked_fill（）详解PyTorch`masked_fill_()`vs.

墨绿色的摆渡人·2025-03-19 07:25

pytorch小记（十）：pytorch中torch.tril 和 torch.triu 详解

pytorch小记（十）：pytorch中torch.tril和torch.triu详解PyTorch`torch.tril`和`torch.triu`详解1.

墨绿色的摆渡人·2025-03-19 07:55

AIGC带来数据革命：R语言如何成为数据科学家的秘密武器？

文章目录一、R语言的基础特性1.1R语言的起源与发展1.2R语言的核心优势二、R语言在AIGC中的应用场景2.1数据预处理与清洗2.2文本分析与生成2.3机器学习与模型构建2.4数据可视化与报告生成三、

程序边界·2025-03-18 19:22

edger多组差异性分析_R语言统计分析微生物组数据

我的已有笔记汇总如下：宏基因组学习笔记宏基因组学习笔记2宏基因组笔记(第二章)R语言宏基因组学统计分析学习笔记(第三章-1)R语言宏基因组学统计分析学习笔记(第三章-2)https://link.springer.com

weixin_39961636·2025-03-18 16:57

23章12节：抽样的蒙特卡洛方法

本文旨在介绍如何利用R语言实现蒙特卡洛方法，特别是如何通过接受‐拒绝抽样从已知分布中抽取样本。文章以参数为(3,

DAT｜R科学与人工智能·2025-03-18 11:18

关于非线性优化小记

非线性优化（NonlinearOptimization）1.什么是非线性优化？非线性优化是指目标函数或约束条件中至少有一个是非线性的优化问题。它广泛应用于工程、经济、人工智能、机器学习等领域，用于求解最优解的问题。非线性优化通常可以表示为以下数学形式：min⁡xf(x)或max⁡xf(x)\min_{x}f(x)\quad\text{或}\quad\max_{x}f(x)xminf(x)或xmax

文弱_书生·2025-03-18 10:34

Pytorch 小记第八回：GoogleNet卷积神经网络模型代码

本次小记，提供了一份基于pytorch的GoogleNet卷积神经网络模型的代码。除此之外，对代码中不容易理解的部分进行了讲解。

Start_Present·2025-03-18 01:15

R语言使用table1包绘制（生成）三线表实战：单变量分列构建三线表、编写自定义函数在三线表中添加p值

R语言使用table1包绘制（生成）三线表实战：单变量分列构建三线表、编写自定义函数在三线表中添加p值目录R语言使用table1包绘制（生成）三线表、使用单变量分列构建三线表、编写自定义函数在三线表中添加

statistics.insight·2025-03-17 12:12

R语言的移动应用开发

R语言的移动应用开发在数据科学和统计分析的大潮中，R语言因其强大的数据处理和可视化能力而备受青睐。然而，R语言对移动应用开发的适用性并未得到广泛关注。

滕若岚·2025-03-17 00:10

R语言：初始环境配置

文章目录R语言的配置URL和种子R语言的配置在R中安装languageserver包：（直接在R.exe中运行即可）install.packages("languageserver")关于jupyternotebook

一头大学牲·2025-03-17 00:09

【科研绘图系列】R语言绘制网络相关图（cor network plot）

文章目录介绍加载R包数据下载导入数据数据预处理画图1画图2组合图形输出图片系统信息介绍【科研绘图系列】R语言绘制网络相关图（cornetworkplot）加载R包library(tidyverse)library

生信学习者1·2025-03-16 20:42

ggplot2设置坐标轴范围_作图技巧018篇第二坐标轴在ggplot2中的实现

“ggplot2中的次级坐标轴”生活科学哥-R语言科学2020-06-128：35在平时作图中，我们有时希望在一个坐标中进行二个坐标轴的设定，也是为了方便数据的显示。

weixin_39618597·2025-03-16 15:36

23章9节：分层随机抽样及其在R语言中的实现与验证

本文旨在系统地阐述分层随机抽样的理论基础、抽样方法及其在R语言中的实现，

DAT｜R科学与人工智能·2025-03-16 11:01

R语言高效数据处理-自定义EXCEL数据排版

注：以下代码均为实际数据处理中的笔记摘录，所以很零散1、自定义excel表数据输出格式、布局在实际数据处理中为了提升效率，将Excel报表交付给需求方时减少手动调整的环节很有必要#1.1设置表头格式header_style=0', style=sheet_style)#数据写入writeData(data_deal_main01,'data_deal_test1',data_de

LEEBELOVED·2025-03-16 08:43

Java：AI 浪潮中的隐形支柱 —— 探秘 Java 在人工智能领域的独特地位

引言在人工智能技术席卷全球的今天，当人们谈论AI开发时，Python、R语言、C++等工具总是最先被提及。

琢磨先生David·2025-03-15 19:15

【小记】Windows7各版本下载链接

敲键盘的Q·2025-03-15 13:57

R 语言科研绘图第 31 期 --- 韦恩图-基础

为了便于使用，本系列文章介绍的所有绘图都已收录到了sciRplot项目中，获取方式：R语言科研绘图模板---sciRplothttps://mp.weixin.qq.com/s/QA_8LVqjkdg4A16zLonw4w

TigerZ 生信宝库·2025-03-15 06:48

GAN生成对抗网络小记

生成对抗网络（GAN）深入解析：数学原理与优化生成对抗网络（GenerativeAdversarialNetwork,GAN）是一个基于博弈论的深度学习框架，通过生成器（G）和判别器（D）之间的对抗训练，生成高度逼真的数据。其核心思想是让GGG生成伪造数据以欺骗DDD，而DDD则努力分辨真实数据与伪造数据。GAN在理论上可以看作一个极小极大（Minimax）优化问题。1.GAN的数学公式1.1生成

文弱_书生·2025-03-14 11:38

23章11节：自助抽样及其在R语言中的实现与验证

在统计学中，数据分析的核心任务之一是如何在样本数据的基础上推断总体的性质。传统方法往往依赖于已知的概率分布假设和解析推导，但在现实问题中，我们往往无法准确得知总体分布，或者数据样本量较小，难以满足经典统计推断方法的要求。自助抽样作为一种非参数的计算方法，为我们提供了基于样本数据“自我重复”构建抽样分布的途径。1977年，斯坦福大学的B.Efron在著名论文《BootstrapMethods:Ano

DAT｜R科学与人工智能·2025-03-13 18:12

R语言将向量数据按照行方式转化为矩阵数据（设置参数byrow为TRUE）

R语言将向量数据按照行方式转化为矩阵数据（设置参数byrow为TRUE）目录R语言将向量数据按照行方式转化为矩阵数据（设置参数byrow为TRUE）R语言是解决什么问题的？

sdgfbhgfj·2025-03-12 15:58

R语言学习实例：使用R进行数据可视化

R语言学习实例：使用R进行数据可视化R语言是一种功能强大且广泛使用的统计分析和数据可视化工具。在本实例中，我们将使用R语言来创建一些常见的数据可视化图表，包括散点图、柱状图和折线图。

PixelCoder·2025-03-11 11:15

探索R语言：经典案例解析与源代码

探索R语言：经典案例解析与源代码引言：R语言是一种流行的数据分析和统计建模工具，具有丰富的功能和广泛的应用领域。在本文中，我们将通过经典案例来探索R语言的一些重要功能和技术。

翠绿探寻·2025-03-11 10:12

R语言dataframe数据索引、访问: 使用attach函数绑定dataframe数据、这样可以直接使用列名称访问dataframe的列数据

R语言dataframe数据索引、访问:使用attach函数绑定dataframe数据、这样可以直接使用列名称访问dataframe的列数据目录R语言dataframe数据索引、访问:使用attach函数绑定

omhdxgb·2025-03-11 05:35

R语言向量vector数据类型元素索引、访问：使用中括号[]和:符号以及乘法符号获取向量中指定范围内的偶数索引元素

R语言向量vector数据类型元素索引、访问：使用中括号[]和:符号以及乘法符号获取向量中指定范围内的偶数索引元素目录R语言向量vector数据类型元素索引、访问：使用中括号[]和:符号以及乘法符号获取向量中指定范围内的偶数索引元素

omhdxgb·2025-03-11 05:35

R语言安装github包出现的错误，object "XXX" is not exported by "namespace:viridisLite"

下图借用以为博主的图（https://blog.csdn.net/yw_vine/article/details/79631042）原连接R语言安装github包出现的错误，ob

momo酱豆是沃·2025-03-10 17:32

R语言 ggplot2 可视化生成高分辨率图片实战

R语言ggplot2可视化生成高分辨率图片实战在数据分析和可视化领域，R语言一直是研究人员和数据科学家们的首选工具。其中，ggplot2包是R语言中最受欢迎和强大的可视化工具之一。

PixelEnigma·2025-03-10 15:21

Java 中操作 R：深度整合与高效应用

Java中操作R：深度整合与高效应用引言随着大数据和机器学习的快速发展，R语言在数据分析和可视化方面扮演着越来越重要的角色。

froginwe11·2025-03-10 15:18

R语言对高频交易订单流进行建模分析 4

一、实验介绍--订单流模型拟合1.1实验知识点指数核hawkes过程拟合正反馈强度分析订单量影响分析1.2实验环境R3.4.1Rstudio二、订单流模型拟合在上节中我们对订单流数据做了一些统计分析，对交易的一些特征有了一些粗浅的理解，在本节中我们要做的是利用实际数据来拟合hawkes过程，看一看真实数据的订单流动力学中有什么特征。首先我们仍是选出交易时间内的数据：library(tidyvers

oxuzhenyi·2025-03-10 11:54

R语言对高频交易订单流进行建模分析 3

一、实验介绍--订单流数据描述分析1.1实验知识点订单流数据表示订单间隔分析订单信息率平稳性研究订单流动性研究限价单相对价格分析1.2实验环境R3.4.1Rstudio二、订单流数据描述分析2.1订单流数据表示当我们在金融市场上做交易时，可以看到一个委托单簿，上面陈列着买价和卖价以及它们对应的量，举个例子，比特币市场的订单簿：可以看到红色代表的是卖价，或者说是ask,而绿色代表的是买价，或者说是b

oxuzhenyi·2025-03-10 11:53

【自学笔记】R语言基础知识点总览-持续更新

提示：文章写完后，目录可以自动生成，如何生成可参考右边的帮助文档文章目录R语言基础知识点总览1.R语言简介2.R语言安装与环境配置3.R语言基础语法3.1数据类型3.2向量与矩阵3.3数据框与列表4.控制结构

Long_poem·2025-03-10 09:37

搭建测试用的redis集群访问失败小记

redis运行在virtualbox虚拟机的ubuntu中。golang编写的redis客户端代码运行在windows下。首先在ubuntu下启动redis集群下载redis源码，编译成功后，进入utils/create-cluster目录，运行./create-clusterstart./create-clustercreate在windows下编写访问redis代码packagemainimp

yinhezhanshen·2025-03-09 09:42

R语言决策树、svm支持向量机、随机森林

本人正在学习R语言，想利用这个平台记录自己一些自己的学习情况，方便以后查找，也想分享出来提供一些资料给同样学习R语言的同学们。

别叫我名字20·2025-03-09 01:08

决策树、朴素贝叶斯、随机森林、支持向量机、XGBoost 和 LightGBM算法的R语言实现

基本逻辑（1）使用rnorm函数生成5个特征变量x1到x5，并根据这些特征变量的线性组合生成一个二分类的响应变量y；（2）将生成的数据存储在数据框中，处理缺失值，并将响应变量转换为因子类型；（3）使用决策树、朴素贝叶斯、随机森林、支持向量机、XGBoost和LightGBM六种机器学习模型算法对数据进行训练和评估；（4）将各个模型的准确率和AUC值存储在结果数据框中，并通过柱状图展示结果。1.R包

生信与基因组学·2025-03-09 00:18

窗户11 JH小记(xswl 随时失效版)

窗户11JH方式小记JH方式JH方式本文仅用作记录JH方式，具体JHM可以自行搜1.JHMJHM:XXXXX-XXXXX-XXXXX-XXXXX-XXXXX(JHM参考)2.Terminal执行命令Win

水兵没月·2025-03-08 13:51

R语言2——数据类型和基本运算

R语言2——数据类型和基本运算目录R语言2——数据类型和基本运算1.R的数据类型1.R的数据类型（1）Logical（逻辑型）：只有两个值TRUE,FALSE（2）Numeric（数字）：整数、小数等（

朝荣·2025-03-08 03:04

R语言获取数据——手工输入数据

在R语言中获取数据集的方法有多种，例如读取Excel文件、数据库中的文件，而当我们没有这些渠道能够获取到数据集时，也可以手工输入数据，即通过键盘输入数据，它是获取数据集的最简单方法。

蜗牛数据分析·2025-03-08 03:58

R语言——数据框

R语言——数据框data.table/data.frame1、数据框数据框是R的一个重要数据类型,用来存储表格数据2、可认为是特殊类型的列表,列表中每个元素(每类)都有同样的长度每一列3、可以是不同的类型

高现实·2025-03-08 02:23

R语言入门——数据类型和数据结构

变量基本说明R语言计算的过程中，通常需要使用变量来存放中间结果。变量相当于给定一个空间，只能保存一种数据结构，只保存最后一次被赋值的数据。无需事先声明。

Sean1014·2025-03-08 02:52

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