1、在IIS中对每个网站进行单独的应用程序池配置。即互相之间不影响。
2、设置应用程序池的回收时间，默认为1720小时，可以根据情况修改。同时，设置同时运行的w3wp进程数目为1。再设置当内存或者cpu占用超过多少，就自动回收内存
一般来说，这样就可以解决了。但仍然会出现个别网站因为程序问题，不能正确释放。
那么，怎么样才能找到是哪一个网站的？
1、在任务管理器中增加显示pid字段。就可以看到占用内存或者cpu最高的进程pid
2、在命令提示符下运行iisapp -a。注意，第一次运行，会提示没有js支持，点击确定。然后再次运行就可以了。这样就可以看到pid对应的应用程序池
3、到iis中察看该应用程序池对应的网站，就ok了。
最近公司服务器总出现CPU100%占用情况，服务器配置为双核Xeon3.0x2，2G ECC内存。
发现是w3wp.exe长时间占用大量CPU.出现这种情况应该是网站程序存在死循环等问题所致。
在找到问题以前可以暂时采取限制w3wp进程CPU使用率的方法保证网站可以将就着工作：
在IIS6下，经常出现w3wp.exe的内存及CPU占用不能及时释放，从而导致服务器响应速度很慢。
解决CPU占用过多：
1、在IIS中对每个网站进行单独的应用程序池配置。即互相之间不影响。
2、设置应用程序池的CPU监视，不超过25%（服务器为4CPU），每分钟刷新，超过限制时关闭。
根据w3wp取得是哪一个应用程序池：
1、在任务管理器中增加显示pid字段。就可以看到占用内存或者cpu最高的进程pid
2、在命令提示符下运行iisapp -a。注意，第一次运行，会提示没有js支持，点击确定。然后再次运行就可以了。这样就可以看到pid对应的应用程序池。（iisapp实际上是存放在 C:windowssystem32目录下的一个VBS脚本，全名为iisapp.vbs，如果你和我一样，也禁止了Vbs默认关联程序，那么就需要手动到该目录，先择打开方式，然后选“Microsoft (r) Windows Based Script Host”来执行，就可以得到PID与应用程序池的对应关系。）
3、到iis中察看该应用程序池对应的网站，就ok了，做出上面的内存或CPU方面的限制，或检查程序有无死循环之类的问题。
解决内存占用过多，可以做以下配置：
1、在IIS中对每个网站进行单独的应用程序池配置。即互相之间不影响。
2、设置应用程序池的回收时间，默认为1720小时，可以根据情况修改。再设置当内存占用超过多少（如500M），就自动回收内存。
我的设置如下：
首先是对CPU的限制：在启用cpu监视后，我设置该应用程序池最大的cpu使用率为50%。设置刷新cpu时间为1分钟，设置操作为“关闭”。最大工作进程数设置为1。这个意思是，IIS刷新检测该独立池的CPU使用情况时间为1分钟，如果超过设置的cpu限制50％，就会发出关闭池的指令，要求池在指定的时间内关闭。如果池成功在这个时间内关闭，IIS会重启动一个新池，此段时间很短，一般不会有什么感觉，池就重新开启了，对于访问网站的人基本是不会有感觉的。但如果池没有在指定时间内关闭，IIS就会强行关闭它一个刷新CPU时间。在这个停止的时间内，网站无法访问，提示“Service Unavaliable”。
关闭时间和启动时间间隔设置：设短一些比如10秒，这样当您的网站程序大量占用系统资源时IIS自动快速回收进程并且快速启动进程，您的网站暂时还可以将就着工作。
对内存的限制及进程回收时间的设置：我设置为内存占用超过800M就自动回收内存,虚拟内存没有做限制。进程回收时间我保持默认没有修改。各位可以根据自己的情况设置更短的时间。对应用程序池最大虚拟内存也可以在此进行设置，超过了设置的最大虚拟内存，该池会就被回收。
最后综合落伍wlmmc的一些经验，总结一些需要注意的问题：
1、 要限制一个站点的CPU使用，必须将该站点设置为独立应用程序池，共用应用程序池是无法限制单个站点的。IIS独立应用程序池，就需要独立的进程，非常消耗内存。独立池越多，就有越多的W3WP进程。对于每个站点均要独立应用程序池的服务器，在一般的普通P43.0 2G内存的普通服务器上，建议不要超过50个站点，最好30以内，不然服务器压力非常大。在配置上，我一般把资源消耗较大的网站独立一个池，一般普通BBS或者生成HTML的系统大概5个站一个池。普通网站以及一些企业站点均共用一个池。
2、根据wlmmc的经验，在服务器硬件允许的情况下，一般不要限制站点内存使用，这样能够保证网站运行，不会出现用户掉线情况。需要限制某站的最大虚拟内存不要小于64M，不然可能出现一些未知的错误。
3、这些都不是根本解决办法，它的根本问题是网站程序有问题，要解决根本问题还要从程序查起。根据本文开头提到的方法查到具体的应用程序池，找到使用此应用程序池的网站，解决网站程序存在的问题，如死循环之类。
4、除了w3wp.exe, 在调用数据库进行大量查询操作的时候，也会大量占用CPU资源，这是难免的（数据库方面的语句及结构优化不在本文讨论范围之内）。个人认为，只要不是CPU长时间占用100%， 一般在75%左右都是正常的。
非常愿意和各位在服务器配置、优化、安全等方面进行交流和讨论。