Storm通过rJava调用R脚本的环境配置

Storm Bolt中通过rJava调用R脚本时，需要配置本地的R环境及修改Storm的环境。

1、本地R配置

系统安装R语言, HDP-UTILS中提供R的安装包，将这些包配置本地yum源

# yum install R

重新配置R的java环境变量

# R CMD javareconf

进入R中安装rJava或者本地安装

# R CMD INSTALL rJava_0.9-8.tar.gz

R中测试rJava，没有错误说明安装成功

> library(rJava)

2、设置strom环境

修改Advanced storm-site页签下java.library.path参数，新增参数值

:/usr/lib64/R/library/rJava/jri

修改节点storm配置目录下的storm-env.sh，在JAVA_HOME下新增内容

export R_HOME=/usr/lib64/R

问题：

a)缺少jri依赖的包

将依赖的jri-0.8.8-osx.jar拷贝到/usr/hdp/2.6.1.0-129/storm/extlib目录下

b)R脚本执行过程会出现找不到安装包的情况

R中执行".libPaths()”查看安装包所造所有路径，可以通过以下方法调试：

test2<- function(args2){

msg <- tryCatch({

   json <- fromJSON(args2)

   jsonResult <- toJSON(json)

   return(as.character(jsonResult))

  }, error = function(e) {

    e

  })

  return(paste(msg, collapse = "\n"))

}