Spark Executor在YARN上的内存分配

一个Executor对应一个JVM进程。

Spark的角度看,Executor占用的内存分为两部分:ExecutorMemoryMemoryOverhead

 

 

 

 

一、ExecutorMemory

ExecutorMemoryJVM进程Java堆区域。大小通过属性spark.executor.memory设置。也可以在spark-submit命令时用参数--executor-memory设置。

 

用于缓存RDD数据memoryStore位于这一区域。

 

memoryStore占用空间的比例通过属性spark.storage.memoryFraction和spark.storage.safetyFraction控制

相关源码:

//core/src/main/scala/org/apache/spark/storage/BlockManager.scala
/** Return the total amount of storage memory available. */
private def getMaxMemory(conf: SparkConf): Long = {
  val memoryFraction = conf.getDouble("spark.storage.memoryFraction", 0.6)
  val safetyFraction = conf.getDouble("spark.storage.safetyFraction", 0.9)
  (Runtime.getRuntime.maxMemory * memoryFraction * safetyFraction).toLong
}


所以,一个Executor用于存储RDD的空间=(ExecutorMemory MEMORY_USED_BY_RUNTIME) * spark.storage.memoryFraction *spark.storage.safetyFraction

 

 

二、MemoryOverhead

MemoryOverheadJVM进程中除Java以外占用的空间大小,包括方法区(永久代)、Java虚拟机栈、本地方法栈、JVM进程本身所用的内存、直接内存(Direct Memory等。通过spark.yarn.executor.memoryOverhead设置,单位MB

相关源码:

//yarn/common/src/main/scala/org/apache/spark/deploy/yarn/YarnSparkHadoopUtil.scala
  val MEMORY_OVERHEAD_FACTOR = 0.07
  val MEMORY_OVERHEAD_MIN = 384

//yarn/common/src/main/scala/org/apache/spark/deploy/yarn/YarnAllocator.scala
  protected val memoryOverhead: Int = sparkConf.getInt("spark.yarn.executor.memoryOverhead",
    math.max((MEMORY_OVERHEAD_FACTOR * executorMemory).toInt, MEMORY_OVERHEAD_MIN))
......
      val totalExecutorMemory = executorMemory + memoryOverhead
      numPendingAllocate.addAndGet(missing)
      logInfo(s"Will allocate $missing executor containers, each with $totalExecutorMemory MB " +
        s"memory including $memoryOverhead MB overhead")


 

三、相关问题

如果用于存储RDD的空间不足,先存储的RDD的分区会被后存储的覆盖。当需要使用丢失分区的数据时,丢失的数据会被重新计算

如果Java或者永久代的内存不足,则会产生各种OOM异常,executor会被结束。spark会重新申请一个container运行executor。失败executor上的任务和存储的数据会在其他executor上重新计算。

如果实际运行过程中ExecutorMemory+MemoryOverhead之和(JVM进程总内存)超过container的容量。YARN会直接杀死containerexecutor日志中不会有异常记录。spark同样会重新申请container运行executor


Java以外的JVM进程内存占用较多的情况下,应该将MemoryOverhead设置为一个足够大的值,应该将MemoryOverhead设置为一个足够大的值,以防JVM进程因实际占用的内存超标而被kill。如果默认值math.max((MEMORY_OVERHEAD_FACTOR *executorMemory).toInt,MEMORY_OVERHEAD_MIN不够大,可以通过spark.yarn.executor.memoryOverhead手动设置一个更大的值。

 

参考资料:

http://www.wdong.org/wordpress/blog/2015/01/08/spark-on-yarn-where-have-all-my-memory-gone/

http://stackoverflow.com/questions/28404714/yarn-why-doesnt-task-go-out-of-heap-space-but-container-gets-killed

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