HDFS深入理解

本文参考《Hadoop权威指南》与网上相关资料整理完成
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1 HDFS简介

HDFS(Hadoop Distributed File System)是Hadoop项目的核心子项目,是分布式计算中数据存储管理的基础,是基于流数据模式访问和处理超大文件的需求而开发的,可以运行于廉价的商用服务器上。它所具有的高容错、高可靠性、高可扩展性、高获得性、高吞吐率等特征为海量数据提供了不怕故障的存储,为超大数据集(Large Data Set)的应用处理带来了很多便利。

2 HDFS优缺点

2.1 优点:

1) 高容错性

数据自动保存多个副本。它通过增加副本的形式,提高容错性。某一个副本丢失以后,它可以自动恢复,这是由 HDFS 内部机制实现的,我们不必关心。
  
2) 适合批处理

它是通过移动计算而不是移动数据。它会把数据位置暴露给计算框架。

3) 适合大数据处理

处理数据达到 GB、TB、甚至PB级别的数据。能够处理百万规模以上的文件数量,数量相当之大。能够处理10K节点的规模。

4) 流式文件访问

一次写入,多次读取。文件一旦写入不能修改,只能追加和删除。它能保证数据的一致性。

5) 可构建在廉价机器上

Hadoop不需要特别贵的、可靠的机器,可运行于普通商用机器(可以从多家供应商采购) 。

2.2 缺点

1) 低延时数据访问

比如毫秒级的来存储数据,这是不行的,它做不到。它适合高吞吐率的场景,就是在某一时间内写入大量的数据。但是它在低延时的情况下是不行的,比如毫秒级以内读取数据,这样它是很难做到的。

2) 大量小文件存储

文件的元数据(如目录结构,文件block的节点列表,block-node mapping)保存在NameNode的内存中, 整个文件系统的文件数量会受限于NameNode的内存大小。经验而言,一个文件/目录/文件块一般占有150字节的元数据内存空间。如果有100万个文件,每个文件占用1个文件块,则需要大约300M的内存。因此十亿级别的文件数量在现有商用机器上难以支持。

3) 并发写入、文件随机修改

一个文件只能有一个写,不允许多个线程同时写。仅支持数据 append(追加),不支持文件的随机修改。

3 HDFS核心概念

3.1 Blocks

物理磁盘中有块的概念,磁盘的物理Block是磁盘操作最小的单元,读写操作均以Block为最小单元,一般为512 Byte。文件系统在物理Block之上抽象了另一层概念,文件系统Block物理磁盘Block的整数倍。通常为几KB。Hadoop提供的df、fsck这类运维工具都是在文件系统的Block级别上进行操作。

HDFS的Block块比一般单机文件系统大得多,默认为128M。HDFS的文件被拆分成block-sized的chunk,chunk作为独立单元存储。比Block小的文件不会占用整个Block,只会占据实际大小。例如, 如果一个文件大小为1M,则在HDFS中只会占用1M的空间,而不是128M。

刚刚提到HDFS中的Block默认为128M,比一般单机文件系统大得多,原因是为了最小化查找(seek)时间,控制定位文件与传输文件所用的时间比例。假设定位到Block所需的时间为10ms,磁盘传输速度为100M/s。如果要将定位到Block所用时间占传输时间的比例控制1%,则Block大小需要约100M。 但是如果Block设置过大,在MapReduce任务中,Map或者Reduce任务的个数如果小于集群机器数量,会使得作业运行效率很低。

Block的拆分使得单个文件大小可以大于整个磁盘的容量,构成文件的Block可以分布在整个集群, 理论上,单个文件可以占据集群中所有机器的磁盘。 Block的抽象也简化了存储系统,对于Block,无需关注其权限,所有者等内容(这些内容都在文件级别上进行控制)。 Block作为容错和高可用机制中的副本单元,即以Block为单位进行复制。

3.2 Namenode & Datanode

整个HDFS集群由Namenode和Datanode构成master-worker(主从)模式。Namenode复杂构建命名空间,管理文件的元数据等,而Datanode负责实际存储数据,负责读写工作。

Namenode

Namenode存放文件系统树及所有文件、目录的元数据。元数据持久化为2种形式:

1)namespcae image
2)edit log

但是持久化数据中不包括Block所在的节点列表,及文件的Block分布在集群中的哪些节点上,这些信息是在系统重启的时候重新构建(通过Datanode汇报的Block信息)。

在HDFS中,Namenode可能成为集群的单点故障,Namenode不可用时,整个文件系统是不可用的。HDFS针对单点故障提供了2种解决机制:

1)备份持久化元数据
将文件系统的元数据同时写到多个文件系统, 例如同时将元数据写到本地文件系统及NFS。这些备份操作都是同步的、原子的。

2)Secondary Namenode
Secondary节点定期合并主Namenode的namespace image和edit log, 避免edit log过大,通过创建检查点checkpoint来合并。它会维护一个合并后的namespace image副本, 可用于在Namenode完全崩溃时恢复数据。

Secondary Namenode通常运行在另一台机器,因为合并操作需要耗费大量的CPU和内存。其数据落后于Namenode,因此当Namenode完全崩溃时,会出现数据丢失。 通常做法是拷贝NFS中的备份元数据到Second,将其作为新的主Namenode。

在HA中可以运行一个Hot Standby,作为热备份,在Active Namenode故障之后,替代原有Namenode成为Active Namenode。

Datanode

数据节点负责存储和提取Block,读写请求可能来自namenode,也可能直接来自客户端。数据节点周期性向Namenode汇报自己节点上所存储的Block相关信息。

3.3 Block Caching

DataNode通常直接从磁盘读取数据,但是频繁使用的Block可以在内存中缓存。默认情况下,一个Block只有一个数据节点会缓存。但是可以针对每个文件可以个性化配置。

作业调度器可以利用缓存提升性能,例如MapReduce可以把任务运行在有Block缓存的节点上。

用户或者应用可以向NameNode发送缓存指令(缓存哪个文件,缓存多久), 缓存池的概念用于管理一组缓存的权限和资源。

3.4 HDFS Federation

我们知道NameNode的内存会制约文件数量,HDFS Federation提供了一种横向扩展NameNode的方式。在Federation模式中,每个NameNode管理命名空间的一部分,例如一个NameNode管理/user目录下的文件, 另一个NameNode管理/share目录下的文件。

每个NameNode管理一个namespace volumn,所有volumn构成文件系统的元数据。每个NameNode同时维护一个Block Pool,保存Block的节点映射等信息。各NameNode之间是独立的,一个节点的失败不会导致其他节点管理的文件不可用。

客户端使用mount table将文件路径映射到NameNode。mount table是在Namenode群组之上封装了一层,这一层也是一个Hadoop文件系统的实现,通过viewfs协议访问。

3.5 HDFS HA

在HDFS集群中,NameNode依然是单点故障(SPOF)。元数据同时写到多个文件系统以及Second NameNode定期checkpoint有利于保护数据丢失,但是并不能提高可用性。这是因为NameNode是唯一一个对文件元数据和file-block映射负责的地方, 当它挂了之后,包括MapReduce在内的作业都无法进行读写。

当NameNode故障时,常规的做法是使用元数据备份重新启动一个NameNode。元数据备份可能来源于:

1)多文件系统写入中的备份
2)Second NameNode的检查点文件

启动新的Namenode之后,需要重新配置客户端和DataNode的NameNode信息。另外重启耗时一般比较久,稍具规模的集群重启经常需要几十分钟甚至数小时,造成重启耗时的原因大致有:
1) 元数据镜像文件载入到内存耗时较长。
2) 需要重放edit log
3) 需要收到来自DataNode的状态报告并且满足条件后才能离开安全模式提供写服务。

Hadoop的HA方案

采用HA的HDFS集群配置两个NameNode,分别处于Active和Standby状态。当Active NameNode故障之后,Standby接过责任继续提供服务,用户没有明显的中断感觉。一般耗时在几十秒到数分钟。
HA涉及到的主要实现逻辑有

1) 主备需共享edit log存储。
主NameNode和待命的NameNode共享一份edit log,当主备切换时,Standby通过回放edit log同步数据。
共享存储通常有2种选择

NFS:传统的网络文件系统
QJM:quorum journal manager
QJM是专门为HDFS的HA实现而设计的,用来提供高可用的edit log。QJM运行一组journal node,edit log必须写到大部分的journal nodes。通常使用3个节点,因此允许一个节点失败,类似ZooKeeper。注意QJM没有使用ZK,虽然HDFS HA的确使用了ZK来选举主Namenode。一般推荐使用QJM。

2)DataNode需要同时往主备发送Block Report
因为Block映射数据存储在内存中(不是在磁盘上),为了在Active NameNode挂掉之后,新的NameNode能够快速启动,不需要等待来自Datanode的Block Report,DataNode需要同时向主备两个NameNode发送Block Report。

3)客户端需要配置failover模式(对用户透明)
Namenode的切换对客户端来说是无感知的,通过客户端库来实现。客户端在配置文件中使用的HDFS URI是逻辑路径,映射到一对Namenode地址。客户端会不断尝试每一个Namenode地址直到成功。

4)Standby替代Secondary NameNode
如果没有启用HA,HDFS独立运行一个守护进程作为Secondary Namenode。定期checkpoint,合并镜像文件和edit日志。

如果当主Namenode失败时,备份Namenode正在关机(停止 Standby),运维人员依然可以从头启动备份Namenode,这样比没有HA的时候更省事,算是一种改进,因为重启整个过程已经标准化到Hadoop内部,无需运维进行复杂的切换操作。

NameNode的切换通过代failover controller来实现。failover controller有多种实现,默认实现使用ZooKeeper来保证只有一个Namenode处于active状态。

每个Namenode运行一个轻量级的failover controller进程,该进程使用简单的心跳机制来监控Namenode的存活状态并在Namenode失败是触发failover。Failover可以由运维手动触发,例如在日常维护中需要切换主Namenode,这种情况graceful failover,非手动触发的failover称为ungraceful failover。

在ungraceful failover的情况下,没有办法确定失败(被判定为失败)的节点是否停止运行,也就是说触发failover后,之前的主Namenode可能还在运行。QJM一次只允许一个Namenode写edit log,但是之前的主Namenode仍然可以接受读请求。Hadoop使用fencing来杀掉之前的Namenode。Fencing通过收回之前Namenode对共享的edit log的访问权限、关闭其网络端口使得原有的Namenode不能再继续接受服务请求。使用STONITH技术也可以将之前的主Namenode关机。

最后,HA方案中Namenode的切换对客户端来说是不可见的,前面已经介绍过,主要通过客户端库来完成。

4 HDSF交互方式

4.1命令行

HDFS提供了各种交互方式,例如通过Java API、HTTP、shell命令行的。命令行的交互主要通过hadoop fs来操作。

Hadoop中,文件和目录的权限类似于POSIX模型,包括读、写、执行3种权限:

读权限(r):用于读取文件或者列出目录中的内容

写权限(w):对于文件,就是文件的写权限。目录的写权限指在该目录下创建或者删除文件(目录)的权限。

执行权限(x):文件没有所谓的执行权限,被忽略。对于目录,执行权限用于访问器目录下的内容。

每个文件或目录都有owner,group,mode三个属性,owner指文件的所有者,group为权限组。mode
由所有者权限、文件所属的组中组员的权限、非所有者非组员的权限组成。

文件权限是否开启通过dfs.permissions.enabled属性来控制,这个属性默认为false,没有打开安全限制,因此不会对客户端做授权校验,如果开启安全限制,会对操作文件的用户做权限校验。特殊用户superuser是Namenode进程的标识,不会针对该用户做权限校验。

4.2 WEB接口

如果需要查看集群状态或者浏览文件目录,可以访问Namenode暴露的Http Server查看集群信息,一般在namenode所在机器的50070端口。

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5 HDFS读文件

大致读文件的流程如下:

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步骤分解
1)客户端传递一个文件Path给FileSystem的open方法

2)DFS采用RPC远程获取文件最开始的几个block的datanode地址。Namenode会根据网络拓扑结构决定返回哪些节点(前提是节点有block副本),如果客户端本身是Datanode并且节点上刚好有block副本,直接从本地读取。

3)客户端使用open方法返回的FSDataInputStream对象读取数据(调用read方法)

4)DFSInputStream(FSDataInputStream实现了改类)连接持有第一个block的、最近的节点,反复调用read方法读取数据

5)第一个block读取完毕之后,寻找下一个block的最佳datanode,读取数据。如果有必要,DFSInputStream会联系Namenode获取下一批Block 的节点信息(存放于内存,不持久化),这些寻址过程对客户端都是不可见的。

6)数据读取完毕,客户端调用close方法关闭流对象

在读数据过程中,如果与Datanode的通信发生错误,DFSInputStream对象会尝试从下一个最佳节点读取数据,并且记住该失败节点, 后续Block的读取不会再连接该节点 。读取一个Block之后,DFSInputStram会进行检验和验证,如果Block损坏,尝试从其他节点读取数据,并且将损坏的block汇报给Namenode。
客户端连接哪个datanode获取数据,是由namenode来指导的,这样可以支持大量并发的客户端请求,namenode尽可能将流量均匀分布到整个集群。
Block的位置信息是存储在namenode的内存中,因此相应位置请求非常高效,不会成为瓶颈。

6 HDFS写文件

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步骤分解
1)客户端调用DistributedFileSystem的create方法

2)DistributedFileSystem远程RPC调用Namenode在文件系统的命名空间中创建一个新文件,此时该文件没有关联到任何block。 这个过程中,Namenode会做很多校验工作,例如是否已经存在同名文件,是否有权限,如果验证通过,返回一个FSDataOutputStream对象。 如果验证不通过,抛出异常到客户端。

3)客户端写入数据的时候,DFSOutputStream分解为packets,并写入到一个数据队列中,该队列由DataStreamer消费。

4)DateStreamer负责请求Namenode分配新的block存放的数据节点。这些节点存放同一个Block的副本,构成一个管道。 DataStreamer将packer写入到管道的第一个节点,第一个节点存放好packer之后,转发给下一个节点,下一个节点存放 之后继续往下传递。

5)DFSOutputStream同时维护一个ack queue队列,等待来自datanode确认消息。当管道上的所有datanode都确认之后,packer从ack队列中移除。

6)数据写入完毕,客户端close输出流。将所有的packet刷新到管道中,然后安心等待来自datanode的确认消息。全部得到确认之后告知Namenode文件是完整的。 Namenode此时已经知道文件的所有Block信息(因为DataStreamer是请求Namenode分配block的),只需等待达到最小副本数要求,然后返回成功信息给客户端。

7 HDFS副本存放策略

HDFS的副本的存放策略是可靠性、写带宽、读带宽之间的权衡。默认策略如下:

第一个副本放在客户端相同的机器上,如果机器在集群之外,随机选择一个(但是会尽可能选择容量不是太慢或者当前操作太繁忙的)
第二个副本随机放在不同于第一个副本的机架上。
第三个副本放在跟第二个副本同一机架上,但是不同的节点上,满足条件的节点中随机选择。
更多的副本在整个集群上随机选择,虽然会尽量便面太多副本在同一机架上。
副本的位置确定之后,在建立写入管道的时候,会考虑网络拓扑结构。下面是可能的一个存放策略:
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这样选择很好的平衡了可靠性、读写性能
可靠性:Block分布在两个机架上
写带宽:写入管道的过程只需要跨越一个交换机
读带宽:可以从两个机架中任选一个读取

8 Hadoop节点距离

在读取和写入的过程中,namenode在分配Datanode的时候,会考虑节点之间的距离。HDFS中,距离没有 采用带宽来衡量,因为实际中很难准确度量两台机器之间的带宽。
Hadoop把机器之间的拓扑结构组织成树结构,并且用到达公共父节点所需跳转数之和作为距离。事实上这是一个距离矩阵的例子。下面的例子简明地说明了距离的计算:

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Hadoop集群的拓扑结构需要手动配置,如果没配置,Hadoop默认所有节点位于同一个数据中心的同一机架上。

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