区块链与基因数据的奇妙碰触

前言:提到基因,你的脑海中闪现的是什么呢?神秘,遗传,我们的生命密码,疾病。。。那你是否真的近距离了解过自己的基因序列,或是在医疗行为时用到基因的帮助呢?也许你听过基因库,但却不知道它到底怎样发挥功能,因为涉及到安全以及隐私的问题,我们知道对基因的研究有助于人类解决一些医学上的杂题,但并没有多少人愿意分享自己的基因密码用于科学研究。那区块链的特性,去中心化,匿名,信息不可篡改等特点正好解决了信任问题,如果你也对此感兴趣,此文正是雪中送炭。

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原文标题:Q&A: Blockchain-based platform for largest genomic data hub

原文链接:http://www.digitaljournal.com/tech-and-science/science/q-a-blockchain-based-platform-for-largest-genomic-data-hub/article/527374

By  TIM SANDLE


位于德国慕尼黑的Shivom是一个基于区块链的平台,创建了世界上最大的基因组数据中心,宣布与SingularityNet的合作,而SingularityNet也是基于区块链的平台,并提供人工智能服务。

在短短15秒内筹集了3300万美元后,Shivom与SingularityNet建立了合作伙伴关系,以便将区块链,AI和基因组研究相整合,进而实现先进的个性化医疗分析。 Shivom的平台将为患者和基因组数据捐赠者提供安全的解决方案,同时为服务提供商创建一个开放的网络市场。

服务提供商将有机会将他们的服务与基因组数据分析和个性化医疗一起添加到平台。通过该平台,SingularityNet的生物AI团队正在开展一系列关于长寿基因组学的研究项目,旨在支持最大限度地延长人类健康寿命的医学研究。

为了发现有关该项目的更多信息,Digital Journal采访了Shivom的联合创始人兼首席执行官Axel Schumacher博士。

DJ:你为什么决定成立Shivom?

Axel Schumacher: 通过在生物信息学领域工作和帮助建立制药行业的基因组学软件平台时,我注意到制药公司在构建解决方案时遇到的一些问题可以通过区块链技术解决。目前在医疗保健中存在的典型问题有:无法访问数据,数据泄露,无法操作或晦涩难懂的医疗保健数据,数据所有权不明确以及数据可移植性。

例如,医疗保健数据以各种格式在不同的数据库存储时,不能满足社会的最大效用,福利和医疗需求。区域化信息,尤其是基因组学数据,极大地限制了医疗服务提供者进行有效的研究和药物开发。

因此,我开始更详细地研究在医疗保健领域区块链的潜在用例,甚至还出了一系列相关的书籍。在接下来的几个月里,我收到了来自世界各地的精彩反馈,以至于Shivom团队开始致力于研究精准医学运用区块链的综合商业模式。

DJ:基因组数据库背后的目标是什么?

Schumacher:数据中心最重要的一个特色是人们拥有自己的数据,和决定他们信息的使用方式。通常使用遗传学,其数据的个人不会保留任何形式的所有权或控制数据的使用方式。Shivom的目标是利用区块链的技术能力,使个人能够保留对其数据的所有权。

区块链还允许个人向那些他们认为有需要的人授予对该数据的访问权限,例如他们的医生,或他们想要支持的研究机构,或者正在开发治疗他们可能会得的病症的制药公司。通过做这些事情,我们希望公司能够成为安全数据存储和交换的场所,并且在平台上有更多用户,然后我们可以开发数据市场,许多不同的医疗保健服务可以通过权限进行互连和交互使用,从而使数据更有价值,更开放,更安全。

DJ:基因组来自哪里?

Schumacher:我们将从各种来源收集基因组数据。首先,我们允许参与者提交来自其他遗传服务平台和实验室的数据,例如,他们可能从其他测序公司获得信息。应该允许人们将他们的数据传输到他们选择的任何服务提供商。已经有数百万人可以访问他们的序列,还可以在我们的平台上轻松地使用他们的数据。

目前,常用的数据由SNP和外显子组数据组成; 然而,随着全基因组测序的价格下降,我们将开始产生更多的全基因组数据。我们还在开发自己的序列组,用户可以订购和提交样品进行测序以生成基因组数据。此外,我们还与合作伙伴和医疗保健组织合作,帮助补贴测序研究,以便为我们的平台生成最大量的全基因组序列信息,进而为我们的用户提供最有价值的见解。

此外,我们将直接与患者,基因组计划,患者支持团体,医院,保险公司,制药和诊断公司,医疗设备制造商以及政府合作收集数据。我们已经建立了许多合作关系,但仍继续努力拓展更多的合作伙伴,以便让我们的测序试点继续前进。

DJ:请你举个例子说明?

Schumacher:例如,我们与印度安得拉邦政府签署了一项合作协议,开始在那里进行一些试点工作。我们还在研究一些有针对性的疾病领域,在这些领域,我们可以获得有助于在全球各个机构的特定学科中推动医学发展的测序信息。

除基因组数据外,我们还希望整合并行技术,例如,从电子健康记录收集的信息,通过物联网等各种设备(如可穿戴技术),以及最终其他组学数据(特别是代谢组学和微生物组数据)来补充基因组信息。通过这一点,我们希望将所有可能的数据源结合起来,为我们的用户和患者提供最有价值的见解。

DJ:区块链又是怎样影响数据中心的呢?

Schumacher:区块链技术是我们精准医学生态系统的核心部分,因为它同时兼具了多种优势,因此成为建立信任平台的优秀技术。Blockchain具有许多关键功能,使其成为基因组数据组件的存储和共享的理想选择。主要是因为区块链提供额外的安全保障和信任基础,如数据无法修改或篡改,这对处于高度监管下的医疗领域尤为重要。此外,区块链有助于隐私安全,确保身份保密,用户信息不易访问,这激发人们更渴望分享他们的宝贵数据。另外,它允许用户保留数据所有权及使用权 1)仅公开关于用户的必要信息2)用户控制信息公开

区块链还可以帮助连接利益相关者,消除一些不必要的中间人,减少医疗保健系统的成本。该技术还有助于跨境操作,使用户可以在任何地方操作,包括服务水平低下的市场,如印度,巴西,土耳其或中东等转型国家。所有这些都可以通过分散信息来实现(数据不存储在一个集中式数据库中),因此区块链不提供单个黑客访问点。在智能合约的帮助下,区块链允许通过预先写好的协议自动触发实时交易,这使得Shivom生态系统中的交易变得快速,廉价且无差错。

DJ:SingularityNet 为这个项目提供了什么呢?

Schumacher:SingularityNET团队由在人工智能和深度学习上有创新的先驱组成。他们因对世界上第一个Humanoid'Sophia开发做出贡献而闻名。KingularityNET的分散式AI网络为人类开发,共享和货币化AI服务和算法提供了一个开放的市场。人工智能理论非常适合模拟我们基因组监管环境中的复杂依赖关系,可以帮助预测个体发生某些疾病的可能性。因此,我们相信AI将在我们的平台中发挥核心作用,以更深入地解释遗传信息,例如个体的基因如何影响他们的生活方式或为他们的私人医生提供可行的疗法。

由于SingularityNET AI团队参与了许多研究项目 - 包括那些关注长寿基因组学的项目 - 连接我们的数据源和平台能力将带来许多协同效应。集成完成后,SingularityNET上需要基因组或其他生物数据完成任务的AI代理将能够从Shivom请求数据集。作为回报,如果Shivom客户要求对他们上传的医疗数据执行AI分析,Shivom网络将能够从SingularityNET请求该技术。我们希望通过整合网络加速服务,为客户,研究人员和医疗人员提供能简单清晰理解的个性化健康分析。

DJ:该项目如何推进个性化医疗?

Schumacher:我们的平台有多种方式可以实现新形式的个性化医疗。首先,人们将能够使用基因组数据作为切入点来管理他们的健康状况。在未来几年内,在为个人定制治疗或改善生活方式,提高营养参数来帮助人类更健康更长寿时对基因组信息的运用将成为标准程序。通过将各种“组学”数据与Shivom基于区块链的生态系统中存储的基因组数据相结合,并通过应用最新技术包括人工智能,Shivom通过其医疗服务平台旨在提供深入的科学见解,促进治疗开发,推进分子诊断,生物标志物发现和疾病风险评估。

最终,它将通过致力于预防,缓解和治疗全球疾病来改善人们的生活质量。目前制药业正面临着与新药开发相关的挑战。开发一种新药可能需要数十亿美元。通过使用生物标记物(例如遗传标记物)可以显着降低这些成本,其可显着提高药物开发成功率。

通过确保用户基因组信息的安全访问,我们反过来帮助推进测序工作,从而帮助基因组数据在全球范围内可用,以便制药和其他组织(如公共卫生计划)可以在获得许可的基础上访问推动他们的研发工作。此外,通过在人口和地理位置进行测序工作,通常很少这样做(我们计划在印度和非洲开展项目),我们将帮助揭示一系列地理区域中存在的独特遗传模式。这种独特而新颖的DNA信息在此之前尚未被开发,可以大大有助于改善研究和精准医学。

DJ:哪些公司和组织会使用这项服务?

Schumacher:典型的客户将是能够最大限度地利用大型医疗数据集来推进其研发计划的组织,以及利用这些集中存储的大量数据节省大量成本的组织。这些客户可能是进行基于人群研究的制药公司,学术中心或研究组织。保险公司可以使用这些数据来识别导致疾病的疾病源点或致病的环境因素。

医生可以使用该数据库为患者找到更好的治疗方法。患者支持小组可能会赞助针对其社区量身定制的新研究项目。从长远来看,新客户可能转向MedTech和IoT垂直市场,还有那些将使用Shivom平台提高客户健康状况的医疗保健提供商。

点评:通读此文,感觉令人兴奋而有收获。如果人类真的能很好利用基因密码,解决目前一些科技仍解决不了的疑难杂症,和延长人类的寿命,实在是顶好顶好的。所以区块链的产生真是人类的福音,希望能看到区块链技术的应用落地。


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