1.梯度爆炸
原因：在学习过程中，梯度变得非常大，使得学习的过程偏离了正常的轨迹。
症状：观察输出日志(runtime log)中每次迭代的loss值，你会发现loss随着迭代有明显的增长，最后因为loss值太大以致于不能用浮点数去表示，所以变成了NaN。
可采取的方法：1.降低学习率，比如solver.prototxt中base_lr，降低一个数量级（至少）。如果在你的模型中有多个loss层，就不能降低基础的学习率base_lr，而是需要检查日志，找到产生梯度爆炸的层，然后降低train_val.prototxt中该层的loss_weight。
2.错误的学习率策略及参数
原因：在学习过程中，caffe不能得出一个正确的学习率，相反会得到inf或者nan的值。这些错误的学习率乘上所有的梯度使得所有参数变成无效的值。
症状：观察输出日志(runtime log)，你应该可以看到学习率变成NaN，例如：
... sgd_solver.cpp:106] Iteration 0, lr = -nan
可采取的方法：修改solver.prototxt文件中所有能影响学习率的参数。比如，如果你设置的学习率策略是 lr_policy: "poly" ，而你又忘了设置最大迭代次数max_iter，那么最后你会得到lr=NaN...
关于caffe学习率及其策略的内容，可以在github的/caffe-master/src/caffe/proto/caffe.proto 文件中看到 (传送门)。
下面是源文件的注释部分的描述：
// The learning rate decay policy. The currently implemented learning rate
// policies are as follows:
// - fixed: always return base_lr.
// - step: return base_lr * gamma ^ (floor(iter / step))
// - exp: return base_lr * gamma ^ iter
// - inv: return base_lr * (1 + gamma * iter) ^ (- power)
// - multistep: similar to step but it allows non uniform steps defined by
// stepvalue
// - poly: the effective learning rate follows a polynomial decay, to be
// zero by the max_iter. return base_lr (1 - iter/max_iter) ^ (power)
// - sigmoid: the effective learning rate follows a sigmod decay
// return base_lr ( 1/(1 + exp(-gamma * (iter - stepsize))))
//
// where base_lr, max_iter, gamma, step, stepvalue and power are defined
// in the solver parameter protocol buffer, and iter is the current iteration.
3.错误的损失函数
原因：有时，在损失层计算损失值时会出现NaN的情况。比如，向InfogainLoss层没有归一化输入值，使用自定义的损失层等。
症状：观察输出日志(runtime log)的时候，你可能不会发现任何异常：loss逐渐下降，然后突然出现NaN。
可采取的方法：尝试重现该错误，打印损失层的值并调试。
举个栗子：有一回，我根据批量数据中标签出现的频率去归一化惩罚值并以此计算loss。如果有个label并没有在批量数据中出现，频率为0，结果loss出现了NaN的情况。在这种情况下，需要用足够大的batch来避免这个错误。
4.错误的输入
原因：你的输入中存在NaN！
症状：一旦学习过程中碰到这种错误的输入，输出就会变成NaN。观察输出日志(runtime log)的时候，你可能也不会发现任何异常：loss逐渐下降，然后突然出现NaN。
可采取的方法：重建你的输入数据集(lmdb/leveldn/hdf5...)，确保你的训练集/验证集中没有脏数据（错误的图片文件）。调试时，使用一个简单的网络去读取输入，如果有一个输入有错误，这个网络的loss也会出现NaN。
5.Pooling层的步长大于核的尺寸
由于一些原因，步长stride>核尺寸kernel_size的pooling层会出现NaN。比如：
layer {
name: "faulty_pooling"
type: "Pooling"
bottom: "x"
top: "y"
pooling_param {
pool: AVE
stride: 5
kernel: 3
}
}
结果y会出现NaN。
原文链接：https://stackoverflow.com/questions/33962226/common-causes-of-NaNs-during-training