推荐一套来自哈佛的R语言和差异分析学习课程

巧。今天是更新的第324天，我们的实验室门牌也是324。周末在清华呆了两天，明天还继续，多次错过的第三天培训这次终于能补上了。感受到了神圣的氛围，今天天很蓝，校园里的花都开了（突然感觉像在写作文，可是没有高中时候的文笔了），只能说，路边走的都是神仙啊，还去食堂蹭了一顿牛肉面，只顾着激动了，没有感受到好不好吃！（不重要的，周围都是神仙，吃嘛嘛香）~~~这两天开阔眼界，看到了天外的天，人外的人，更有动力努力向前！晚上回到办公室，感觉自己下凡了，脚踏实地加油。

推荐一套来自哈佛的R语言和差异分析学习课程：https://hbctraining.github.io/Intro-to-R-with-DGE/schedule/

R基础

✓熟悉rstudio（R的图形界面）
✓使用rstudio流利地与r交互
✓熟悉r语法
✓了解R中的数据结构
✓检查和操作数据结构
✓在r中安装包和使用函数
✓使用简单和复杂的绘图方法可视化数据

差异分析

✓了解对RNA-seq数据进行统计分析的注意事项
✓从基因计数开始（校准和计数后）对计数数据进行质量控制。
✓使用deseq2对计数数据进行差异表达分析，获得一个差异显著的基因列表。
✓差异表达基因的可视化

具体时间安排

Day1上午

R和Rstudio R简介
R语法和数据结构
函数和参数

Day1下午

R包和库
取子集：向量和因子
取子集：数据框、矩阵和列表
匹配和重新排序

Day2 上午

复习
匹配和重新排序（续）
R语言数据可视化
Tidyverse

Day2 下午

差异分析的工作流
差异分析准备工作：counts数据标准化
差异分析准备工作：counts数据质控

Day3 上午

DESeq2方法概述
差异分析：成对比较(Wald Test)
差异分析结果汇总与可视化
差异分析工作流总结

Day3 下午

差异分析：复杂的实验设计
功能分析
总结

接下来我要根据这个课程的设计和思路，修正我自己的课程不足之处，借助哈佛的气场，加油！