没错，我还在用MEGA7

慌不择路，建树来凑，年终总结的时候感觉没什么可讲的就临时起意建了个进化树，哈哈哈哈。。。

结果死的可惨了，记得点赞吖吖吖吖，嘿嘿。

来吧，康康MEGA7的简单建树是如何实现的

1st 序列准备

MEGA7需要的是几个FASTA序列合并后的文件，就像这样的fasta文件

fasta序列合并后的文件

如何得到这样的合并后的.fasta 文件呢？

小白不会使用各大软件，只知道 ①NCBI上可以批量下载序列，批量下载下来的序列就是这个样子的；②有些数据库好像不具备这些功能，只能手动合并了，一个是用更改.fasta文件后缀名为.txt，然后用粘贴复制的方式合并；③当然windows系统自带批量合并文本文件的方式，在文件夹中写入一个.bat脚本文件后运行 具体方法可参看此链接 https://blog.csdn.net/zejunwzj/article/details/82345029；④在cmd窗口用dos命令实现，具体方式可以参看此链接，此方法个人推荐⑤用BioEdit软件将序列都打开，然后建立新序列，一个个复制进去，挺麻烦；④将序列传到Linux系统中去，用cat命令列出来传入到新的文件中，这个操作比较简单快捷，个人推荐。

2nd 序列比对与.mas格式保存

用MEGA7将以上合并得到的.fasta文件打开，打开时在以下界面选择 Align

选择 Align

文件打开后，选择中文件中所有的序列，点击 Alignment → ClustalW → OK 参数就默认呗，暂时还不太懂

Align界面

然后就可以点击 保存 按钮，将其保存为.mas格式，该格式用于之后的建树。保存后这个.fasta文件就可以毫不犹豫地关掉啦。

3rd 建树

在File选项中打开刚刚保存的.mas格式文件，这次打开 Analyze 一下也是可以的。

打开.mas文件

之后就可以在 Phylogeny 和 User Tree 选项中选择建树方式了，一般会使用 NJ Tree 或最大似然法建树（Maximum Likelihood Tree）

建树参数表

建树所需的参数嘛，俺还不太懂，默认吧就 Compute !

建树界面

如此一来简单的建树是好了，在Options选项（就顶上那个锤子）中可以美化图中字体、线条粗细等，Branch Style 选项可以选择不同的建树图案，Image选项可以将建好的树输出为PDF、图片等格式。本次建树的经验是序列名字短一点建树会好看些。。。

当然，核酸序列和蛋白质序列都可以用来建树，步骤是差不多滴。

Over啦，记得点赞吖吖吖吖，嘿嘿。