week2-蛋白质与蛋白质的结构、酶及其他、糖酵解

https://www.zybuluo.com/Agathe-Zhu/note/148841
【1】关于极性氨基酸的分类，可以理解为COO带负电而NH3带正点

本周的作业稍难，形式多样很有趣，但是会做错有没有-O-。。。当然每道题下面有discussion会提供一些思路，Whisper_of_the_Wind亲开了个讨论贴http://mooc.guokr.com/post/606529/ ，在遵守Honor Code的前提下可以互帮互助。
总结一下本周内容：
Lecture 3是蛋白质的结构，生物大分子那些不甚有趣。就是要备个小条记好20种氨基酸的极性啊，电荷啊，疏水性啊，那几个special的也是在hydrophobic里的。说实话，以前学生化的时候对这些键啊，特性啊，没有觉得什么重要，但是这门课里还是比较强调的。。。。。蛋白质结构展示包括1）全原子模式（展示1级结构基础)，2）卡通模式（展示2级结构基础）， 3）棍棒模式（可突出部分结构，观察基团间作用），三维的示例还是比较得我心的，平面的化学式完败。。Lab Video里面那个X线测结构的可以结合着看，知道这些三维来源的实际基础。。。蛋白结构part的重点是，Foldit大家玩了没有，俺卡在4.3关了，过不去啊。。。求抱大腿，可以交流经验。。
Lecture 4 就开始讲酶了，让自己设想一个模通道的开场很touching。。。之后，噔噔噔噔，传说中的save the day的TIM出场了，这个梗到Lecure 5的最后才完满，放长线钓大鱼的节奏啊，教授。。。之前一个师姐做的TIM3，这番才知道，哎呦，是个把G3P转成DHAP的酶偶，在病态增高说明能量转换强劲的节奏？。。。
关于酶的作用机制，Lander讲得很通俗易懂，我回翻了一下以前的教材，一句“降低反应活化能”抽象了一切啊，果然还是视觉系的讲一下TIM的具体过程比较nice。。。做题发现，Oh，只有俩个氨基酸跟底物结合啊的直观比“活化中心”的抽象概念触动大很多。。。不知道大家的生物化学是怎么教的，反正我学的很抽象，唉，各种背背佳。。。那个病毒跟人“合体”的视屏有没有牛人有啊，想看全部唉。。充分利用了溶酶体的弱点达到自己的目的是以前就知道的，但是没有想过具体过程是那么的精巧，纤细。。。众virus“合体”的感觉，越老越丰富的被转染的细胞体系，阿门。。。
Lecture 5呼应之前的fermentation，先从糖酵解开刀，TIM的梗也在算ATP时得以终结。。。狂爱整个pathway的图，一定要贴的

连接糖代谢和氨基酸代谢的强图，直接把我打翻在地啊，亲，为什么没有早遇见你。。。。。
在讲蛋白质2级结构的时候，提到Linus Pauling，Wiki一下，也是个强人啊。。。膜拜膜拜。。。。流水帐一下，安慰做题后的心情。。。