Metascape

之前本来准备使用DAVID软件进行基因富集分析的,后来听说DAVID更新比较慢,最近一次更新是2016年,上一次的更新则是2012年,还是在被Nature点名批评之后进行的更新。另外,Metascape则操作亲(sha)民(gua),最重要的是数据更新及时,很多基因注释及时跟进。
于是我准备转战Metascape

  • 打开主页,清新扑面而来:


    Metascape_第1张图片
    Metascape主页
  • 我愉快的提交了差异基因列表:


    Metascape_第2张图片
    提交基因列表
  • 她已经自动帮我选定了物种:


    Metascape_第3张图片
    自动识别物种
  • 立马她就上车了:


    Metascape_第4张图片
    点击Express Analysis

    静静的等待富集。

  • 结果就这么呈现了:


    Metascape_第5张图片
    分析结果

    我下载了PDF看看:


    Metascape_第6张图片
    点击即可下载

    我比较贪心,于是:
  • 打包下载所有数据:


    Metascape_第7张图片

文件可以导入cytoscape里面进行修饰,有些数据用excel文件进行图示输出。


Metascape_第8张图片
i解压后的文件

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