R包的安装（包含windows、linux的命令安装及源码安装方式）

一、install.packages("所需包名称")  命令安装R包

#R包介绍官网：https://cloud.r-project.org/  点击左侧Task Views
#R包的安装，联网的在线安装（最常用：很好的解决依赖问题），或者下载源码安装
#在线安装命令：install.packages("所需包名称")，首次安装请使用R端（非RStudio),因为需要选择镜像站点。
#首次使用打开R端>install.packages() ，选择镜像站点（如：China (Shanghai)）确认即可

#install.packages()安装测试，windows和linux一样
install.packages("vcd")  #安装"vcd"包
install.packages("devtools", dependencies = T) #安装开发者工具包，并制定自动安装依赖包
.libPaths()  #查看包的安装路径
library()    #查看库里面有哪些安装包，有包的解释
.packages(all.available=T)  #查看库里面有哪些安装包，只有包的名称

install.packages(c("plotrix","ABCanalysis"))  #一次安装多个包
update.packages()  #更新安装的软件包

   

二、下载源码安装R包

（1）、下载源码安装R的拓展包

进入官网：https://cloud.r-project.org/index.html  ，点击packages，点击：Table of available packages, sorted by name  ，找到需要安装的包点击进入（如：ABCanalysis），进入后查看是否需要其他依赖包（如：ABCanalysis依赖于plotrix）

 

（2）、根据系统下载安装所需要的包（包含依赖包），这里已Linux系统为例

[root@hdp04 ~]# which R      #查看R在linux中的安装路径：（我这里是：/usr/bin/R）
[root@hdp04 ~]# R    #直接输入R,进入R

> .libPaths()      #查看包的目录：返回[1] "/usr/lib64/R/library"
> quit()             #退出R

[root@hdp04 ~]# cd /usr/lib64/R/library   #切换目录
[root@hdp04 library]# ll                           #查看已经安装了的包

打开网页对应的安装包页面，选中所需安装包，右击，复制安装包链接地址

# 编写执行脚本
[root@hdp04 library]# vim R_packages.sh
#!/bin/bash
wget https://cloud.r-project.org/src/contrib/plotrix_3.7-7.tar.gz
wget https://cloud.r-project.org/src/contrib/ABCanalysis_1.2.1.tar.gz
R CMD INSTALL -- library=/usr/lib64/R/library/ plotrix_3.7-7.tar.gz
R CMD INSTALL -- library=/usr/lib64/R/library/ ABCanalysis_1.2.1.tar.gz
export R_LIBS=/usr/lib64/R/library
# 给脚本添加可执行权限
[root@hdp04 library]# chmod +x R_packages.sh
# 执行脚本，下载并安装
[root@hdp04 library]# sh R_packages.sh
#查看包
[root@hdp04 library]# ll

R包的使用：https://blog.csdn.net/weixin_41685388/article/details/103925758