R代码脚本的运行

R代码脚本的运行

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R代码脚本的运行

2010-08-05 10:58

在复习 《An Introduction to R》的时候， 偶然发现了附录B4 "Scripting with R"。 内容使我惊喜万分 OS: Ubuntu 9.10 1.在后台运行R 1.1创建file.R文件 1.2在文件首行键入： #! /path/to/Rscript 1.3在下面的行中，键入R代码 1.4保存(记得有png(),jpeg(),...等函数的代码最后一定要有dev.off()) 1.5在file.R的工作目录下，在终端中输入以下命令: R CMD BATCH --args file.R 1.6 file.R被运行了！！！ 优点： R命令行下打错命令后回车，之前的所有相关命令几乎全军覆没。如果不想发生这种情况，请写一个file.R文件。 缺点：R CMD BATCH 模式是让R在系统后台运行file.R，运行时微微地卡了2s。 2.创建R脚本 2.1创建file.R文件 2.2在文件首行键入： #! /usr/bin/env Rscript 2.3在下面的行中，键入R代码 2.4保存(记得有png(),jpeg(),...等函数的代码最后一定要有dev.off()) 2.5在file.R的工作目录下，在终端中输入以下命令: R CMD BATCH --args file.R 或者Rscript file.R 2.6file.R被运行了！！！ 优点： 比较前者不太占用系统资源， 而且可以在终端在直接运行，这样就可以和BASH语言在一起应用了。 具体如下：  chmod 755 file.R ./file.R                  #这种方式下，把file.R改为file.sh或file ...，在Ubuntu下都能运行 3.在BASH脚本中插入R代码 3.1在file.sh文件中键入： #! /bin/sh R --slave [other option]<# R代码 EOF 3.2在终端下运行 chmod 755    file.sh ./file.sh 3.3 file.sh被运行了，包括里边的R代码 优点： R代码能插在BASH脚本中运行，它就可以在其它更加强大的脚本中运行。事实上R-python已经成了python的一个模块了。 4.回归R环境 1，2中的file.R文件，无论有没有{#! ...}都可以在R环境下以source()命令执行。 > source("/home/***/R/file.R") 这是在使用R的时候，最常用的方法。   参考：W. N. Venables, D. M. Smith and the R Development Core Team, 《An Introduction to R》附录B4 "Scripting with R", 2010

posted on 2011-12-01 23:01  lexus 阅读( ...) 评论( ...) 编辑 收藏

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