面绘制经典算法:MarchingCube实现(控制台篇)

1.MarchingCube

marchingcube是一个比较经典而古老的算法,也是面绘制中应用比较多的算法,Marchingcube发展到今天也遇到了几何拓扑、一致性的问题仍待改善。本文研究的就是经典的marchingcube(Paul,1997).

关于MarchingCube原理(含代码),重点推荐如下:

1.《医学图像三维重建和可视化:VC++实现实例》(张俊华)

2.Bourke P. Polygonising a scalar field[J]. 1997.

3.论文+源代码+交互界面

2.控制台上实现与讨论

算法设计步骤:

1.二维断层图像顺序地读入内存并构成三位数据场;

2.依次扫描相邻两层数据,逐个构造立方体;

3.将立方体每个顶点灰度和给定等值面阈值进行比较,计算索引值;

4.对于含有等值面的立方体,通过灰度差分计算立方体各顶点的梯度;

5.根据索引值查找边索引表,获得和等值面有交点的当前立方体的相交边

6.根据相交边的两个顶点坐标及其法向量,利用差值(中值)计算等值点的坐标与法向量;

7.根据索引值查找三角片索引表,确定当前立方体内构成三角片的等值点的组合方式

8.由各个立方体内的三角面片构成等值面。

#include 
#include 
#include 
#include 
using namespace std;

static int edgeTable[256]={ };    //根据索引值确定立方体和等值面交点情况
static int triTable[256][16] ={ };//根据索引值确定三角面片的个数以及位置

typedef struct  
{
	double x,y,z;
} XYZ;

typedef struct
{
	XYZ p[8];       //顶点坐标
	XYZ n[8];       //法向量
	double val[8];  //顶点对应的灰度值
} GRIDCELL; //立方体

typedef struct 
{
	XYZ p[3];      //顶点坐标
	XYZ c;         //几何中心
	XYZ n[3];      //法向量
} TRIANGLE;

#define ABS(x)  (x < 0 ? -(x) : (x))

//声明
int PolygoniseCube(GRIDCELL , double , TRIANGLE * );
XYZ VertexInterp(double , XYZ , XYZ , double, double );

//3D数据场大小
#define NX 200
#define NY 160
#define NZ 160

int main( int argc, char **argv)
{
	short int*** data = NULL;
	short int isolevel = 128, themax = 0, themin = 255; //等值面 数据场的范围
	GRIDCELL grid;
	TRIANGLE triangles[10];
	TRIANGLE* tri = NULL; //保存的是所有三角形面片的顶点坐标

	int ntri = 0;
	FILE* fptr = NULL;

	//打开并阅读原始文件
	fprintf(stderr, "Reading data...\n");
	errno_t  err;
	err = fopen_s(&fptr,"mri.raw", "rb");
	if( err != NULL ) {
		fprintf(stderr, "File open failed\n");
		exit(-1);
	}

	//为三维数据场分配空间
	data = (short int***) malloc( NX * sizeof(short int **) );
	for (int i=0;i themax )
					themax = str;
				if( str < themin )
					themin = str;
			}
		}
	}
	fclose(fptr);
	fprintf(stderr,"Volumetric data range: %d -> %d\n",themin,themax);
	
	//3D数据场处理
	fprintf(stderr, "polygonising data...\n");
	for (int i=0; i 
       4--------5     *---4----*
      /|       /|    /|       /|
     / |      / |   7 |      5 |
    /  |     /  |  /  8     /  9
   7--------6   | *----6---*   |
   |   |    |   | |   |    |   |
   |   0----|---1 |   *---0|---*
   |  /     |  /  11 /     10 /
   | /      | /   | 3      | 1
   |/       |/    |/       |/
   3--------2     *---2----*
////////////////////////////////////////////////////////////////////////////*/
int PolygoniseCube(GRIDCELL grid, double isolevel, TRIANGLE* tri)
{
	int numOftriangle = 0;
	int cubeIndex = 0;
	XYZ vertlist[12];  //保存等值面与立方体各边相交的坐标
	//确定那个顶点位于等值面内部
	if (grid.val[0] < isolevel) cubeIndex |= 1;
	if (grid.val[1] < isolevel) cubeIndex |= 2;
	if (grid.val[2] < isolevel) cubeIndex |= 4;
	if (grid.val[3] < isolevel) cubeIndex |= 8;
	if (grid.val[4] < isolevel) cubeIndex |= 16;
	if (grid.val[5] < isolevel) cubeIndex |= 32;
	if (grid.val[6] < isolevel) cubeIndex |= 64;
	if (grid.val[7] < isolevel) cubeIndex |= 128;
	
	//异常:立方体所有顶点都在或者都不在等值面内部
	if ( edgeTable[cubeIndex] == 0 )
		return 0;
	//确定等值面与立方体交点坐标
	if (edgeTable[cubeIndex] & 1) {
		vertlist[0] = VertexInterp(isolevel,grid.p[0],grid.p[1],grid.val[0],grid.val[1]);
	 }
	if (edgeTable[cubeIndex] & 2) {
		vertlist[1] = VertexInterp(isolevel,grid.p[1],grid.p[2],grid.val[1],grid.val[2]);
	}
	if (edgeTable[cubeIndex] & 4) {
		vertlist[2] = VertexInterp(isolevel,grid.p[2],grid.p[3],grid.val[2],grid.val[3]);
	}
	if (edgeTable[cubeIndex] & 8) {
		vertlist[3] = VertexInterp(isolevel,grid.p[3],grid.p[0],grid.val[3],grid.val[0]);
	}
	if (edgeTable[cubeIndex] & 16) {
		vertlist[4] = VertexInterp(isolevel,grid.p[4],grid.p[5],grid.val[4],grid.val[5]);
	}
	if (edgeTable[cubeIndex] & 32) {
		vertlist[5] = VertexInterp(isolevel,grid.p[5],grid.p[6],grid.val[5],grid.val[6]);
	}
	if (edgeTable[cubeIndex] & 64) {
		vertlist[6] = VertexInterp(isolevel,grid.p[6],grid.p[7],grid.val[6],grid.val[7]);
	}
	if (edgeTable[cubeIndex] & 128) {
		vertlist[7] = VertexInterp(isolevel,grid.p[7],grid.p[4],grid.val[7],grid.val[4]);
	}
	if (edgeTable[cubeIndex] & 256) {
		vertlist[8] = VertexInterp(isolevel,grid.p[0],grid.p[4],grid.val[0],grid.val[4]);
	}
	if (edgeTable[cubeIndex] & 512) {
		vertlist[9] = VertexInterp(isolevel,grid.p[1],grid.p[5],grid.val[1],grid.val[5]);
	}
	if (edgeTable[cubeIndex] & 1024) {
		vertlist[10] = VertexInterp(isolevel,grid.p[2],grid.p[6],grid.val[2],grid.val[6]);
	}
	if (edgeTable[cubeIndex] & 2048) {
		vertlist[11] = VertexInterp(isolevel,grid.p[3],grid.p[7],grid.val[3],grid.val[7]);
	}
	//根据交点坐标确定三角形面片,并进行保存
	for (int i=0; triTable[cubeIndex][i] != -1; i+=3)
	{
	  tri[numOftriangle].p[0] = vertlist[ triTable[cubeIndex][i  ] ];
      tri[numOftriangle].p[1] = vertlist[ triTable[cubeIndex][i+1] ];
      tri[numOftriangle].p[2] = vertlist[ triTable[cubeIndex][i+2] ];
      numOftriangle++;
	}

	return (numOftriangle);
}
//等值面与立方体交点坐标
XYZ VertexInterp(double isolevel, XYZ p1, XYZ p2, double valp1, double valp2)
{
	XYZ p;
	if (ABS(isolevel-valp1) < 0.00001)
		return(p1);
    if (ABS(isolevel-valp2) < 0.00001)
		return(p2);
    if (ABS(valp1-valp2) < 0.00001)
		return(p1);

	double coef = (isolevel - valp1 ) / (valp2 - valp1);
	p.x = p1.x + coef * (p2.x - p1.x); 
	p.y = p1.y + coef * (p2.y - p1.y);
	p.z = p1.z + coef * (p2.z - p1.z);
       
	return (p);
}

3.学习心得

1.学会定义结构体,例如三维空间的立方体,需要先定义一个坐标XYZ结构体,然后再定义一个立方体结构体,而他们之间恰恰是相互依赖的。

typedef struct  
{
	double x,y,z;
} XYZ;

typedef struct
{
	XYZ p[8];       //顶点坐标
	XYZ n[8];       //法向量
	double val[8];  //顶点对应的灰度值
} GRIDCELL; //立方体
2.如何动态为三位数据场分配空间?

data = (short int***) malloc( NX * sizeof(short int **) );
for (int i=0;i
我们要注意到,利用malloc()函数进行内存申请之后返回来的是void*型的指针,我们需要进行指针的强制类型转换。该段代码也给我一个很深的感悟就是"指针确实是一门艺术"。

3.读取文件以及数据元素读取

errno_t  err;
err = fopen_s(&fptr,"mri.raw", "rb");
if( err != NULL ) {
	fprintf(stderr, "File open failed\n");
	exit(-1);
}
读取文件可以采用fopen或fopen_s两个函数,不同之处在于前者需要提供两个参数,并返回FILE*类型;而后者需要提供三个参数,返回的是errno_t( 实质就是int的别名)类型。相比较而言,fopen_s更安全。
int str; //从文件中读取字符
for (int k=0; k
fgetc()顺序读取数据。

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