4 split函数将data.frame转换成list的方法

将data.frame转换成list的方法

d <- data.frame(gender=c("M","M","F","M","F","F"),age=c(47,59,21,32,33,24),income=c(55000,88000,32450,76500,123000,45650), over25=rep(c(1,1,0), times=2))
d
# gender age income over25
# 1      M  47  55000      1
# 2      M  59  88000      1
# 3      F  21  32450      0
# 4      M  32  76500      1
# 5      F  33 123000      1
# 6      F  24  45650      0

a<- split(d$income, list(d$gender,d$over25)) #将income按照gender、over25分组
class(a)
## 含有两种类标准，变成了list of 4
a[1]
a[2]
a[3]
a[4]
a$F.0
a$M.0
a$F.1
a$M.1
##############
b<- split(d$income, list(d$gender))
# 变成了list of 2

实战:GSVA分析的时候需要一个matrix 和一个gene_sets list格式：我们可以将dataframe变成list

rm(list = ls())
library(readxl)
a <- read_excel("./IO panel 395 gene & pancancer immune gene overlap.xlsx")
View(a)
b<- split(a$Gene,list(a$`Cell type`,a$Immunity))

结果

这样我们就可以进行下游的GSVA分析了。