RStudio制作包含Rcpp代码的R包

前面博客中有提及，当我们进行模拟想要再次进行提速时，通常都会使用Rcpp将我们的R代码改成C++代码。具体Rcpp的使用可参考博客：让你的R代码更快——Rcpp入门，利用RcppEigen进行矩阵运算。

平时在我们使用的时候，直接使用Rcpp::sourceCpp()就可以直接将我们的C++代码中的函数进行导入，这不会遇到什么问题，但如果我们想要使用snowfall进行并行时就不能再这样做了。遇到的问题在博客中有进行说明：R中两种常用并行方法——2. snowfall。

而解决这个问题的有效途径，就是将我们的Rcpp代码进行打包，然后再对包进行调用。下面我们就来介绍：如何使用RStudio制作包含Rcpp代码的R包。

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1. 创建项目

首先我们进入RStudio，然后选择左上角的File—New Project。


新建Project后会得到如下图所示的界面，我们接着选New Directory，

再选择R Package，

最后在得到如下所示的界面后，我们在Package Name中输入我们包的名称，然后再在下面选择Add，将我们的.cpp格式的C++文件选择进去（里面是我们的函数）。最后点击Create package，即可创建一个R包的project了。

创建完之后，RStudio会弹出一个新的界面，如下图所示。

然后我们需要对下述界面里面的一些配置文件进行一定的修改，然后才能完善我们的R包。

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2. 修改一些文件

从上面界面的右下角的Files框框中，可以发现已经多出了很多文件，包括DISCRIPTION等文件以及man、R、src三个文件夹。

在R文件夹中存的是R代码，src文件夹中是C++代码（包括我们之前添加的C++代码）。

可能你的C++代码中只有添加进去.cpp文件，由于我的代码中不止使用了#include ，还有使用#include ，也就是Eigen库进行矩阵操作，所以会多出两个转化的文件。

其实到这里，如果只用了Rcpp里面的一些函数，没有用到C++中的Eigen或者其他库，这时候就已经可以直接包成一个包了，但是会比较丑，这时我们可以修改一些DISCRIPTION文件，添加一些作者姓名等一些重要信息。

直接点开DISCRIPTION文件，会如上图所示，我们直接进行修改即可。这里需要注意一下，Imports里面涉及到软件的版本，是根据你R中现有包的版本来，如果想让更多的电脑使用，在不影响程序使用的前提下，可以适当降低依赖包的版本。

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3. 打包

最后一步就是打包，这里介绍两种打包方式：

1. 选择上方的Build——Build Source Package

2. 点击右上角的Build中的Build & Reload

第一种方法打包成功后，当下面出现DONE字样时，说明包会在默认路径下安详地躺着了。
第二种方法打包成功后会自动library载入。

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4. 使用Eigen或其它依赖库会出现的问题

如果我们再.cpp文件中使用的不止有Rcpp库，还有别的库，比如说Eigen。这时需要注意，用上面的方法打包是失败的，会显示没有Eigen这个库。

这个解决的方法也很简单，直接在DISCRIPTION文件的LinkTo后面加上RcppEigen即可，如下图所示：

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可能遇到的其他问题

• 制作R包后载入包内函数时，出现 “…” not available for .Call() for package “…” 错误

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最后，就可以开心地享用新鲜出炉的包来做snowfall并行或者发给别人使用啦！