病毒感染检测程序（BF模式匹配）18计科教学用

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using namespace std;

typedef struct{   
   char ch[600];				//若是非空串，则按串长分配存储区，否则ch为NULL   
   int len;				//串长度   
}HString; 


int Index_BF(HString S,HString T,int pos)
{//返回模式T在主串S中第pos个字符开始第一次出现的位置。若不存在，则返回值为0 
 //其中，T非空，1≤pos≤StrLength(S) 
	int i,j;
   i=pos; j=1;   
   while(i<=S.len&&j<=T.len)
   { 
      if(S.ch[i]==T.ch[j]){++i;++j;}	//继续比较后继字符 
      else{i=i-j+2;j=1;}	//指针后退重新开始匹配
   }   
   if(j>T.len) return i-T.len;   
   else return 0;   
} 

void Virus_detection()
{ 
   int num,m,flag,i,j; char Vir[600];
   HString Virus,Person,temp;
   ifstream inFile("病毒感染检测输入数据.txt");
   ofstream outFile("病毒感染检测输出结果.txt");
   inFile>>num;//读取待检测的任务数
   while(num--) //依次检测每对病毒DNA和人的DNA是否匹配
   {
      inFile>>Virus.ch+1;//读取病毒DNA序列
      inFile>>Person.ch+1;//读取人的DNA序列
      strcpy(Vir,Virus.ch);
	  Virus.len=strlen(Virus.ch)-1;
	  Person.len=strlen(Person.ch)-1;
	  flag=0;//用来标识是否匹配，初始为0，匹配后为非0
	  m=Virus.len;
      for(i=m+1,j=1;j<=m;j++) Virus.ch[i++]=Virus.ch[j];
      //因病毒为环状，故将病毒的长度扩大2倍
      //即可线性取到所有长度为Virus.len的字符串
      Virus.ch[2*m+1]='\0';				//添加结束符号
      for(i=0;i