第 1 周任务
分类问题:K-邻近算法
分类问题:决策树
第 2 周任务
分类问题:朴素贝叶斯
分类问题:逻辑回归
第 3 周任务
分类问题:支持向量机
第 4 周任务
分类问题:AdaBoost
第 5 周任务
回归问题:线性回归、岭回归、套索方法、逐步回归等
回归问题:树回归
第 6 周任务
聚类问题:K均值聚类
相关问题:Apriori
第 7 周任务
相关问题:FP-Growth
第 8 周任务
简化数据:PCA主成分分析
简化数据:SVD奇异值分解
logistic回归又称logistic回归分析,是一种广义的线性回归分析模型,常用于数据挖掘,疾病自动诊断,经济预测等领域。例如,探讨引发疾病的危险因素,并根据危险因素预测疾病发生的概率等。以胃癌病情分析为例,选择两组人群,一组是胃癌组,一组是非胃癌组,两组人群必定具有不同的体征与生活方式等。因此因变量就为是否胃癌,值为“是”或“否”,自变量就可以包括很多了,如年龄、性别、饮食习惯、幽门螺杆菌感染等。自变量既可以是连续的,也可以是分类的。然后通过logistic回归分析,可以得到自变量的权重,从而可以大致了解到底哪些因素是胃癌的危险因素。同时根据该权值可以根据危险因素预测一个人患癌症的可能性。
Logistic回归是众多分类算法中的一员。通常,Logistic回归用于二分类问题,例如预测明天是否会下雨。当然它也可以用于多分类问题,不过为了简单起见,本文暂先讨论二分类问题。首先,让我们来了解一下,什么是Logistic回归。
首先考虑线性分类器z = w_0 + w_1x_1 +……+ w_kx_k
,为了进行分类任务,利用sigmoid函数将z映射为概率进行分类。Logistic回归通过假设每个事件服从伯努利分布(1,p),而p则受sigmoid函数控制。根据伯努利分布,可写出每个事件的概率分布,再利用极大似然法可求出参数w_1…w_k
,下面分别讨论每一个步骤
Logistic回归中的sigmoid函数形式如下
其中
若利用概率将其写成一个等式来描述y的分布,即 p ( y ) = g ( z ) y ( 1 − g ( z ) ) 1 − y p(y) = g(z)^y(1-g(z))^{1-y} p(y)=g(z)y(1−g(z))1−y
Sigmoid函数有一些特性,其导数如下
假设每个事件 b ( 1 , g ( z i ) ) b(1,g(z_i)) b(1,g(zi)),则根据上文 p ( y i ) = g ( z i ) y i ( 1 − g ( z i ) ) 1 − y i p(y_i) = g(z_i)^{y_i}(1-g(z_i))^{1-y_i} p(yi)=g(zi)yi(1−g(zi))1−yi,由此可求出似然函数L(w)
L ( w ) = ∏ i = 1 n g ( z i ) y i ( 1 − g ( z i ) ) 1 − y i L(w) = \prod_{i=1}^n g(z_i)^{y_i}(1-g(z_i))^{1-y_i} L(w)=i=1∏ng(zi)yi(1−g(zi))1−yi
取对数求得对数似然函数l(w)
l ( w ) = ∑ i = 1 n y i l n g ( z i ) + ∑ i = 1 n ( 1 − y i ) l n ( 1 − g ( z i ) ) ) l(w) = \sum_{i=1}^ny_iln g(z_i) + \sum_{i=1}^n (1-y_i)ln (1-g(z_i))) l(w)=i=1∑nyilng(zi)+i=1∑n(1−yi)ln(1−g(zi)))
对每个 w j w_j wj求其偏导可得
∂ l ( w ) ∂ w j = ∑ i = 1 n y i ( 1 − g ( z i ) ) x i j − ∑ i = 1 n ( 1 − y i ) g ( z i ) x i j = ∑ i = 1 n ( y i − g ( z i ) ) x i j \frac{\partial l(w)}{\partial w_j} = \sum_{i=1}^ny_i(1-g(z_i))x_{ij} - \sum_{i=1}^n(1-y_i)g(z_i)x_{ij}= \sum_{i=1}^n (y_i-g(z_i))x_{ij} ∂wj∂l(w)=i=1∑nyi(1−g(zi))xij−i=1∑n(1−yi)g(zi)xij=i=1∑n(yi−g(zi))xij
可以发现,l(w)的梯度和线性回归类似,只是logistic回归是g(z)而线性回归是z。但由于这点不同导致logistic回归的似然函数写不出最大值的表达式,因此需要通过牛顿法或梯度上升来求得参数。
根据上文有似然函数的梯度如下
∂ l ( w ) ∂ w j = ∑ i = 1 n ( y i − g ( z i ) ) x i j \frac{\partial l(w)}{\partial w_j} = \sum_{i=1}^n (y_i-g(z_i))x_{ij} ∂wj∂l(w)=i=1∑n(yi−g(zi))xij
写成矩阵形式即
∇ w j = ∂ l ( w ) ∂ w j = ( y − 1 1 + e − X W ) ′ x j \nabla_{w_j} = \frac{\partial l(w)}{\partial w_j} = (y-\frac{1}{1+e^{-XW}})'x_j ∇wj=∂wj∂l(w)=(y−1+e−XW1)′xj
那么根据梯度上升每个参数的更新如下,其中 α α α为梯度步长 w j : = w j + α ∇ w j w_j := w_j + \alpha \nabla_{w_j} wj:=wj+α∇wj
如此可求得Logistic回归的权重 w 1 . . . . . . w k w_1......w_k w1......wk
让我们整理一下思路,Logistic的推导思路如下
- 首先z与自变量x线性相关,为了对z进行分类,利用sigmoid函数将其映射为概率p
- 假设每个事件服从伯努利分布,则伯努利分布的参数即为p
- 由此可写出似然函数,利用极大似然估计,根据链式法则求导,再利用梯度上升求得权重 w 1 w_1 w1… w k w_k wk
项目概述
本次实战内容,将原始数据集下载地址。
这里的数据包含了368个样本和28个特征。这种病不一定源自马的肠胃问题,其他问题也可能引发马疝病。该数据集中包含了医院检测马疝病的一些指标,有的指标比较主观,有的指标难以测量,例如马的疼痛级别。另外需要说明的是,除了部分指标主观和难以测量外,该数据还存在一个问题,数据集中有30%的值是缺失的。下面将首先介绍如何处理数据集中的数据缺失问题,然后再利用Logistic回归和随机梯度上升算法来预测病马的生死。
准备数据
数据中的缺失值是一个非常棘手的问题,很多文献都致力于解决这个问题。那么,数据缺失究竟带来了什么问题?假设有100个样本和20个特征,这些数据都是机器收集回来的。若机器上的某个传感器损坏导致一个特征无效时该怎么办?它们是否还可用?答案是肯定的。因为有时候数据相当昂贵,扔掉和重新获取都是不可取的,所以必须采用一些方法来解决这个问题。下面给出了一些可选的做法:
预处理数据做两件事:
import numpy as np
import random
"""
函数说明:sigmoid函数
Parameters:
inX - 数据
Returns:
sigmoid函数
"""
def sigmoid(inX):
return 1.0 / (1 + np.exp(-inX))
"""
函数说明:改进的随机梯度上升算法
Parameters:
dataMatrix - 数据数组
classLabels - 数据标签
numIter - 迭代次数
Returns:
weights - 求得的回归系数数组(最优参数)
"""
def stocGradAscent1(dataMatrix, classLabels, numIter=150):
m,n = np.shape(dataMatrix) #返回dataMatrix的大小。m为行数,n为列数。
weights = np.ones(n) #参数初始化 #存储每次更新的回归系数
for j in range(numIter):
dataIndex = list(range(m))
for i in range(m):
alpha = 4/(1.0+j+i)+0.01 #降低alpha的大小,每次减小1/(j+i)。
randIndex = int(random.uniform(0,len(dataIndex))) #随机选取样本
h = sigmoid(sum(dataMatrix[randIndex]*weights)) #选择随机选取的一个样本,计算h
error = classLabels[randIndex] - h #计算误差
weights = weights + alpha * error * dataMatrix[randIndex] #更新回归系数
del(dataIndex[randIndex]) #删除已经使用的样本
return weights #返回
"""
函数说明:使用Python写的Logistic分类器做预测
Parameters:
无
Returns:
无
"""
def colicTest():
frTrain = open('horseColicTraining.txt') #打开训练集
frTest = open('horseColicTest.txt') #打开测试集
trainingSet = []; trainingLabels = []
for line in frTrain.readlines():
currLine = line.strip().split('\t')
lineArr = []
for i in range(len(currLine)-1):
lineArr.append(float(currLine[i]))
trainingSet.append(lineArr)
trainingLabels.append(float(currLine[-1]))
trainWeights = stocGradAscent1(np.array(trainingSet), trainingLabels, 500) #使用改进的随即上升梯度训练
errorCount = 0; numTestVec = 0.0
for line in frTest.readlines():
numTestVec += 1.0
currLine = line.strip().split('\t')
lineArr =[]
for i in range(len(currLine)-1):
lineArr.append(float(currLine[i]))
if int(classifyVector(np.array(lineArr), trainWeights))!= int(currLine[-1]):
errorCount += 1
errorRate = (float(errorCount)/numTestVec) * 100 #错误率计算
print("测试集错误率为: %.2f%%" % errorRate)
"""
函数说明:分类函数
Parameters:
inX - 特征向量
weights - 回归系数
Returns:
分类结果
"""
def classifyVector(inX, weights):
prob = sigmoid(sum(inX*weights))
if prob > 0.5: return 1.0
else: return 0.0
if __name__ == '__main__':
colicTest()
# 测试集错误率为: 34.33%
错误率还是蛮高的,而且耗时1.9s,并且每次运行的错误率也是不同的,错误率高的时候可能达到40%多。为啥这样?首先,因为数据集本身有30%的数据缺失,这个是不能避免的。另一个主要原因是,我们使用的是改进的随机梯度上升算法,因为数据集本身就很小,就几百的数据量。用改进的随机梯度上升算法显然不合适。让我们再试试梯度上升算法,看看它的效果如何?
import numpy as np
import random
"""
函数说明:sigmoid函数
Parameters:
inX - 数据
Returns:
sigmoid函数
"""
def sigmoid(inX):
return 1.0 / (1 + np.exp(-inX))
"""
函数说明:梯度上升算法
Parameters:
dataMatIn - 数据集
classLabels - 数据标签
Returns:
weights.getA() - 求得的权重数组(最优参数)
"""
def gradAscent(dataMatIn, classLabels):
dataMatrix = np.mat(dataMatIn) #转换成numpy的mat
labelMat = np.mat(classLabels).transpose() #转换成numpy的mat,并进行转置
m, n = np.shape(dataMatrix) #返回dataMatrix的大小。m为行数,n为列数。
alpha = 0.01 #移动步长,也就是学习速率,控制更新的幅度。
maxCycles = 500 #最大迭代次数
weights = np.ones((n,1))
for k in range(maxCycles):
h = sigmoid(dataMatrix * weights) #梯度上升矢量化公式
error = labelMat - h
weights = weights + alpha * dataMatrix.transpose() * error
return weights.getA() #将矩阵转换为数组,并返回
"""
函数说明:使用Python写的Logistic分类器做预测
Parameters:
无
Returns:
无
"""
def colicTest():
frTrain = open('horseColicTraining.txt') #打开训练集
frTest = open('horseColicTest.txt') #打开测试集
trainingSet = []; trainingLabels = []
for line in frTrain.readlines():
currLine = line.strip().split('\t')
lineArr = []
for i in range(len(currLine)-1):
lineArr.append(float(currLine[i]))
trainingSet.append(lineArr)
trainingLabels.append(float(currLine[-1]))
trainWeights = gradAscent(np.array(trainingSet), trainingLabels) #使用改进的随即上升梯度训练
errorCount = 0; numTestVec = 0.0
for line in frTest.readlines():
numTestVec += 1.0
currLine = line.strip().split('\t')
lineArr =[]
for i in range(len(currLine)-1):
lineArr.append(float(currLine[i]))
if int(classifyVector(np.array(lineArr), trainWeights[:,0]))!= int(currLine[-1]):
errorCount += 1
errorRate = (float(errorCount)/numTestVec) * 100 #错误率计算
print("测试集错误率为: %.2f%%" % errorRate)
"""
函数说明:分类函数
Parameters:
inX - 特征向量
weights - 回归系数
Returns:
分类结果
"""
def classifyVector(inX, weights):
prob = sigmoid(sum(inX*weights))
if prob > 0.5: return 1.0
else: return 0.0
if __name__ == '__main__':
colicTest()
# 测试集错误率为: 28.36%
可以看到算法耗时减少了,错误率稳定且较低。很显然,使用随机梯度上升算法,反而得不偿失了。所以可以得到如下结论: