MRI 数据(HCP数据及其他)

HCP预处理pipeline:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23668970

文件夹结构以及每个文件是什么:http://www.humanconnectome.org/documentation/S500/HCP_S500+MEG2_Release_Reference_Manual.pdf
dtseries.nii是皮层数据,大小大概只有64k。数据里面有一个皮层位置模型,皮层数据与其点点对应。

http://humanconnectome.org/documentation/S500/HCP_S500+MEG2_Release_Appendix_III.pdf

两个工具箱:
1. read cifti into matlab(使用这个toolbox才能将dtseries.nii文件读入): https://github.com/Washington-University/cifti-matlab
2. hcp workbench(可用于显示数据): http://www.humanconnectome.org/software/connectome-workbench.html
(直接安装软件即可,无需make文件,网站上还有tutorial)
* wb_view使用遇到问题:1. 本地使用时,cd到目录下但是文件wb_view无法运行,显示不存在该文件:要写”./wb_view”。2. wb_view 可能在cluster上面运行过慢导致数据可载入但无法显示。
* wb_command: http://www.humanconnectome.org/software/workbench-command.php
可以使用wb_command进行文件格式转换等功能,例如:把matlab处理得到的.nii文件变成dtseries.nii文件影射到皮层上去。

000002/MNINonLinear/Results/tfMRI_EMOTION_AP/tfMRI_EMOTION_AP.nii.gz(不是HCP数据,是task-base的)

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