RNA分子m6A机制研究4：核心机理

     m6A 是目前研究的热点，最近出来的高分文章很多。相当多的老师是在研究m6A对靶标RNA的调控机制。我们在2020年底讨论过3类m6A的经典思路。

1. 从甲基酶/去甲基酶入手

视频链接：https://www.bilibili.com/video/BV1my4y1S7DG

其思路是：

1）找到处理组中重要的甲基酶如METTL3, METTL14，去甲基酶FTO等有差异表达，同时过表达敲低后，表型变化显著；

2）敲低后做m6A测序找改变的m6A位点的RNA分子，同时做mRNA-RNAseq找有差异改变的RNA，二者取交集作为潜在的靶标；

3）找出m6A修饰的RNA分子结合的m6A阅读蛋白；

4）证明他们之间的互作关系。

2.  做基因的功能，上游推到m6A

视频链接为：https://www.bilibili.com/video/BV1RD4y1X72R

其文章思路是：

1）发现某个基因有差异，做过表达敲低有表型改变，

2）向下游找靶标，调控下游的蛋白/通路，具体机制考虑该基因的功能；

3）这个基因为什么发生改变呢？发现RNA 存在m6A修饰位点，证明是m6A修饰后引起该RNA分子的功能变化。

3.  找调控甲基化酶/去甲基化酶/阅读蛋白的分子

视频链接为：https://www.bilibili.com/video/BV1eV411h7qT

其文章思路是：

这类文章通常本没有打算做m6A，但靶标分子是m6A相关的酶，所以引入了m6A机制。

1）研究某TF，lnc，circ，某个蛋白，发现靶标是 m6A相关酶；

2）干预该m6A酶时，表型有变化，

3）找m6A酶的 结合的RNA分子，进而确定靶基因。

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    以上是m6A基本机制，然而还需要明确细化很多问题。m6A机制的核心是什么？我们关注的点应该是什么？各种互作关系实验如何证明？做circ，lnc时，我们会首先筛选差异表达的分子，验证其表型，然后找机制。为什么m6A不直接找差异变化的m6A位点，往下做机制呢？

    最新的m6A高分机制文章，在关注哪些问题？

    本期我们讨论，m6A机制的核心，有兴趣的老师可以了解一下。

以下是视频录屏链接，有需要的老师可以观看。

B站 超清链接 ：

上：https://www.bilibili.com/video/BV165411g7PW

下：https://www.bilibili.com/video/BV1D84y1F7Bx