学习小组Day4笔记（补）-阿含-2021-01-17

#######写在前面：最近完成了两个学校的考博申请，目前紧张复习中，之前跟着生信星球的学习因为毕业小论文的事情搁置了，现在抓紧时间，补充起来，加油。

一、配置R环境

1.新换了一台windows电脑 ，跟着果子老师的视频重新配置了R环境。

2.R包的下载根据其所属的包的不同，有两种if语句可以使用

a.如果包属于CRAN:

if(!require("survminer"))install.packages("survminer",update=F,ask=F)

b.如果包属于Bioconductor:

if(!require("Biobase"))BiocManager::install("Biobase",update=F,ask=F)

4.个别包装不上时，考虑R包升级

install.packages(“installr”)
require(“installr”)
updateR()

二、利用R-project 管理项目

当有多个项目并行时，为了高效管理，避免用setwd()设置工作目录的方式，可以利用R-project 分开各项目

方法：

a. 新建project并设置储存位置

b.在储存位置，打开project

c.打开项目后，可以getwd()，然后你目前的工作目录就是所打开的project所在的目录。

三、常用指令

 dir() #显示文件列表
list.files()
history() 
rm(a)  #删除单变量
rm(a,b) #删除多变量
rm(list=ls())  #删除全部变量
ctrl+l #清空控制台
q() #R的退出

加减乘除，赋值都ok

代码推荐用键盘Q前的tab键补齐

一行可以执行多个命令，多命令之间用“；”隔开，

命令中的空格不影响命令执行

四、预习R语言的基本数据结构（对象来划分）

向量

列表

矩阵

数组

因子

数据框

参考资料：

day4-R语言基础：https://m.umu.cn/session/article/2n34S7725?fwx=1
R-project管理多个R工作目录：https://mp.weixin.qq.com/s/G-LXN9P2HVLv9v0cvyFJMA
果子学生信:R语言工作环境配置：https://www.bilibili.com/video/BV1gJ411d729?from=search&seid=5144057078889340649
R语言-初识与数据结构：https://mp.weixin.qq.com/s/Ls8xLobJC0eGNjJt4PMWZw
R语言升级：https://mp.weixin.qq.com/s/7Kfu-klMENWGQOlO6ldQ4w