《学习小组Day4笔记--向伟》

今天是生信学习的的第四天，今天学习了R语言的安装以及一些基础的操作。
R语言也是生信学习的重要一环，不过相比其他的生信软件而言，r语言可以直接在Windows上安装使用（也有Linux版本的）。

1. R语言的介绍

R是一种编程语言，也是统计计算和绘图的环境，它汇集了许多函数，能够提供强大的功能。
R语言软件界面简陋，通常不直接使用，而是用图形界面的Rstudio。
RStudio是免费提供的开源集成开发环境（IDE）。RStudio提供了一个具有很多功能的环境，使R更容易使用，是在终端中使用R的绝佳选择。
----生信星球

2. 安装R语言前的准备

因为RStudio安装的途径需要系统名称是英文的，否则安装以后会无法正常使用。那么如何判断系统名是否为英文的步骤如下：
2.1 随便打开一个文件夹，点击图中红色方框的图标

2.2 显示如图所示的路径，就表明是英文的系统名，可以直接安装

2.3 若显示路径前几级目录为中文，就需要做出更改
详细更改步骤见当Rstudio杠上中文用户名

3. 下载安装R语言程序（R\RStudio）

具体过程见果子学生信安装教程,在此就不做详细介绍了。

4. 简单认识R和Rstudio

R界面

Rstudio界面

打开R和Rstudio的操作界面，我们发现，R略显简陋，而Rstudio就相对丰富多了，存在多个工作界面，有脚本编辑器（左上）、环境显示界面（右上）、控制台（脚本运行和结果显示）(左下)以及文件/图片/帮助/包的界面（右下）。这也使得我们能够更好地使用R语言。

5. Rstudio的参数设置（以字体为例）

5.1 点击上面的菜单栏的Tools，选择Global Options项目

5.2 然后选择Appearance栏，然后选择自己需要更改的主题，字体等

5.3 更改完后，点击Apply应用更改的参数，然后确定即可。其他参数也是如此，不过具体的还需要自己去摸索。

6. R语言的一些基本操作

6.1 用Rproject管理工作目录

所谓工作目录就是默认的读取和储存位置，也就是说，R语言只能和一个文件夹进行互动，这个文件夹非常重要，做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑，找不到。
----来自生信星球

观看来源与生信星球的R-project管理多个R工作目录,你就会得到更进一步的了解。
6.2 显示文件列表

> dir()
[1] "library"

输入目录查询指令，结果就显示一个"library"，就表明在当前工作目录下就存在一个子目录。
6.3 加减乘除计算

> #加法
> 1+9
[1] 10
> #减法
> 2020-1995
[1] 25
> #乘法
> 13*14
[1] 182
> #除法
> 9/3
[1] 3

6.4 赋值
“<-”就表示赋值符号，z<-x-y,就表明将x-y的的结果赋值给了z，一旦在控制台中输入x后，得到的输出结果就是x-y的值
6.5 删除变量
这个命令和Linux的删除命令类似都是使用rm()来删除

a<-3
b <- 1
c <- 4
u <- 5+6
rm(b)
rm(u,c)  
rm(list = ls())#清空所有变量
                    #来自生信星球资料

6.6 查看历史命令
有两种方法：
一是输入history()命令，二是在环境显示界面（右上）的history栏目中查看

6.7 清空控制台
当输入命令过多时，可以通过快捷键ctrl+l来清空，或者是直接点击控制台右上角的扫帚图标就可以清空记录。

今天的学习就到这里了，明天再开始学习新的内容，谢谢！