病毒宏基因组学(Meta-virome)

宏基因组学(Meta-virome)是在宏基因组学理论的基础上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支,是某类样本中所有病毒(virus)或病毒类似物(virus-like-particle)及其所携带遗传信息的总称。宏病毒组直接以环境中所有病毒的遗传物质为研究对象,能够快速准确的鉴定出环境中所有的病毒组成,在病毒发现、病毒溯源、微生物预警等研究方面具有重要作用。宏病毒研究可应用于人或动物肠道或者血液样本、海洋、土壤等的研究,用以挖掘潜在的对人类和环境的危害。

易基因科技同丹麦哥本哈根大学知名微生物课题组联合开发高效的宏病毒组颗粒富集方法,可对微量样本进行病毒颗粒富集,并保证病毒活性及高均质性,为宏病毒组学、噬菌体与细菌之间的互作关系等研究提供优良技术支持,保驾护航!

技术路线
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分析

由NT-V、ViPR、PATRIC、IRD等数据库序列组成的非冗余病毒序列数据库。
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技术参数

样本要求

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样本直接运输(干冰);粪便、土壤、底泥建议
≥400mg(最低不低于200mg);水样需微孔滤膜过滤后送样。

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测序策略:PE150

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其他注意事项:

① 最终样本质量以我司的检测结果为准;

② 若样本总量超过要求,可以进行样本保存,反样;项目完成后,将不再保存剩余样品。

项目周期

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15个样本以下标准运转周期约为45个工作日,大样本量项目需分批建库,项目周期需要与技术支持人员确定。

产品优势

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可对微量样本中的病毒组进行有效分离。

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对噬菌体不造成损伤,最大程度保证了病毒活性,适用于下游FVT研究。

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相较于传统的PEG,CsCl等方法,均质性高,噬菌体偏好性低。

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全面的数据分析策略,定制的多组学关联数据挖掘。

研究案例

噬菌体是粪便病毒组的主要成员,粪便病毒组移植(FVT)或能有效的调节肠道菌群。Gut最新发表了来自丹麦哥本哈根大学团队(易基因合作方)的研究,在该项概念验证试验中发现,接受瘦小鼠的粪便病毒组移植后,饲喂高脂食物的小鼠体重增长变慢,同时还能保持正常的血糖指标,FVT引起的肠道菌群变化介导了这些保护性功能代谢作用。这项研究表明,FVT疗法或能用来改善肥胖和糖尿病等肠道菌群相关代谢类疾病。
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参考文献: Faecal virome transplantation
decreases symptoms of type 2 diabetes and obesity in a murine model DOI:
10.1136/gutjnl-2019-320005

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