python mk趋势检验_python中的Mann-Kendall单调趋势检验--及原理说明

https://blog.csdn.net/liuchengzimozigreat/article/details/87931248

在python中使用Mann-kendall:

Q: Using Mann Kendall in python with a lot of data

在python中使用mann-Kendall,可以用scipy.stats.kendalltau,该函数返回两个值:tau-反映两个序列的相关性,接近1的值表示强烈的正相关,接近-1的值表示强烈的负相关;p_value:p值反映的是假设检验的双边p值,其零假设为无关联——即通常所谓的显著性水平,一般取p<0.05为显著。

其实上面重要的是显著性水平,至于正相关还是负相关我们可以用斜率来表示。斜率可用线性回归的斜率,也可以是Sen’s slope(python中可以用stat包提供的函数来计算)。

??想了解关于风速历年变化趋势,被推荐用Mann-Kendall趋势检验,查到一篇相对详细的介绍,转译成中文以飨诸君。原文:Mann-Kendall Test For Monotonic Trend

??水平有限,如有纰漏,还望斧正。

背景知识

??Mann-Kendall(MK)检验(test)(Mann 1945, Kendall 1975, Gilbert 1987) 的目的是统计评估我们所感兴趣的变量,随着时间变化,是否有单调上升或下降的趋势。单调上升(下降)的趋势意味着该变量随时间增加(减少),但此趋势可能是、也可能不是线性的。MK test可替代参数线性回归分析——线性回归可检验线性拟合直线的斜率是否不为零。回归分析要求拟合回归线的残差是正态分布的,MK检验不需要这种假设,MK检验是非参数检验(不要求服从任何分布-distribution free)

??Hirsch, Slack and Smith (1982, page 107)表明MK检验最好被视作探索性分析,最适合用于识别变化显着或幅度较大的站点,并量化这些结果。

相关前提(assumption)

以下这些假设是MK检验的基础:

当没有趋势时,随时间获得的数据是独立同分布的。独立的假设是说数据随着时间不是连续相关的。

所获得的时间序列上的数据代表了采样时的真是条件。(样本具有代表性)

样本的采集、处理和测量方法提供了总体样本中的无偏且具有代表性的观测值。

MK检验不要求数据是正态分布,也不要求变化趋势——如果存在的话——是线性的。如果有缺失值或者值低于一个或多个检测限制,是可以计算MK检测的,但检测性能会受到不利影响。独立性假设要求样本之间的时间足够大,这样在不同时间收集的测量值之间不存在相关性。

计算

MK检验是检验是否拒绝零假设(null hypothesis: H0),并接受替代假设(alternative hypothesis: Ha):

??H0:没有单调趋势

??Ha:存在单调趋势

最初的假设是:H0为真,在拒绝H0并接受Ha之前,数据必须要超出合理怀疑——要到达一定的置信度。

MK检验的流程 (from Gilbert 1987, pp. 209-213):

??1.将数据按采集时间列出:x1,x2,…,xn,,即分别在时间1,2,…,n得到的数据。

??2.确定所有n(n-1)/2个xj - xk差值的符号,其中j > k,这些差值是:x2 - x1,x3 - x1, … , xn - x1,x3 - x2,x4 - x2,…,xn - xn-2,xn - xn-1

??3.令sgn(xj - xk)作为指示函数,依据xj - xk的正负号取值为1,0或-1,即:

s g n ( x j ? x k ) = { 1 , x j ? x k > 0 0 , x j ? x k = 0 或 者 x j ? x k 的 值 因 没 检 测 ( 数 据 缺 失 ) 而 不 能 确 定 ; ? 1 , x j ? x k < 0 ( 3 ) \boldsymbol{sgn(x_j-x_k)} =

?????1,xj?xk>00,xj?xk=0或者xj?xk的值因没检测(数据缺失)而不能确定;?1,xj?xk<0{1,xj?xk>00,xj?xk=0或者xj?xk的值因没检测(数据缺失)而不能确定;?1,xj?xk<0

\quad\quad\quad\boldsymbol{(3)}sgn(xj?xk)=?????1,xj?xk>00,xj?xk=0或者xj?xk的值因没检测(数据缺失)而不能确定;?1,xj?xk<0(3)

??例如:如果xj - xk > 0,就意味着 j 时刻的观测值——用xj表示,大于 k 时刻的观测值——用xk表示.

??4.计算

????????S=∑ k ? 1 n ? 1 ∑ j ? k + 1 n \boldsymbol{\sum_{k-1}^{n-1}\sum_{j-k+1}^{n}}∑k=1n?1∑j=k+1nsgn(xj - xk) (1)

??即差值为正的数量减去差值为负的数量。如果S是一个正数,那么后一部分的观测值相比之前的观测值会趋向于变大;如果S是一个负数,那么后一部分的观测值相比之前的观测值会趋向于变小。

??5.如果n ≤ \leq≤ 10,依据Gilbert (1987, page 209, Section 16.4.1)中所描述的程序,接下来要在概率表 (Gilbert 1987, Table A18, page 272) 中查找S。如果此概率小于α \alphaα(认为没有趋势时的截止概率),那就拒绝零假设,认为趋势存在。如果在概率表中找不到n(存在结数据——tied data values——会发生此情况),就用表中远离0的下一个值。比如S=12,如果概率表中没有S=12,那么就用S=13来处理也是一样的。

??如果n > 10,则依以下步骤6-10来判断有无趋势。这里遵循的是Gilbert (1987, page 211, Section 16.4.2)中的程序。

??6.计算S的方差如下:

??V A R ( S ) = 1 18 [ n ( n ? 1 ) ( 2 n + 5 ) ? ∑ p ? 1 g t p ( t p ? 1 ) ( 2 t p + 5 ) ] ( 2 ) \boldsymbol{VAR(S)=\frac{1}{18}[n(n-1)(2n+5) - \sum_{p-1}^{g}t_p(t_p - 1)(2t_p+5)]\quad(2)}VAR(S)=181[n(n?1)(2n+5)?∑p?1gtp(tp?1)(2tp+5)](2)

??其中g是结组(tied groups)的数量,t p t_ptp是第p组的观测值的数量。例如:在观测值的时间序列{23, 24, 29, 6, 29, 24, 24, 29, 23}中有g = 3个结组,相应地,对于结值(tiied value)23有t 1 t_1t1= 2、结值24有t 2 t_2t2= 3、结值29有t 3 t_3t3= 3。当因为有相等值或未检测到而出现结时,V A R ( S ) \boldsymbol{VAR(S)}VAR(S)可以通过Helsel (2005, p. 191)中的结修正方法来调整。

??7.计算MK检验统计量Z M K Z_{MK}ZMK,如下:

Z M K = { S ? 1 V A R ( S )   , S > 0   0    , S = 0   S + 1 V A R ( S ) , S < 0 ( 3 ) \quad \quad \quad \quad \boldsymbol{Z_{MK}} =

?????????S?1VAR(S)√ ,S>0 0  ,S=0 S+1VAR(S)√,S<0{S?1VAR(S) ,S>0 0  ,S=0 S+1VAR(S),S<0

\quad\quad\quad\boldsymbol{(3)}ZMK=???????VAR(S)S?1 ,S>0 0  ,S=0 VAR(S)S+1,S<0(3)

??正(负)的Z M K \boldsymbol{Z_{MK}}ZMK表明数据随着时间有增大(减小)的趋势。

??8.设想我们要测试零假设

??H 0 \boldsymbol{H_0}H0:没有单调趋势

????对比替代假设

??H a \boldsymbol{H_a}Ha:有单调增趋势

??其1型错误率为α \alphaα,0 < α < 0.5 00

??9.测试上面的H 0 H_0H0与

??H a \boldsymbol{H_a}Ha:无单调递减趋势

??其1型错误率为α \alphaα,0 < α < 0.5 00

??10.测试上面的H 0 H_0H0与

??H a \boldsymbol{H_a}Ha:有单调递增或递减趋势

??其1型错误率为α \alphaα,0 < α < 0.5 00

缺失数据

??假设时间序列中会有一些缺失数据。比如,数据在每月的第一天被搜集,但是三月一日和七月一日的数据丢失了。在这种情况下V S P VSPVSP会以更小的数据集,以通常所用的方法来计算MK检验,适当地减小n的值。

??

未完待续。。。

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