[cryoEM] cryoSPARC入门教程：处理T20S Proteasome

官方教程指路

1. 创建新的job（快捷键：N）
2. 在该job中，创建新的workspace（快捷键：N）
3. 下载数据集（约８G）。命令：cryosparcm downloadtest，然后解压tar -xf empiar_10025_subset.tar。
4. 导入Movies。
5. 运动矫正。
6. CTF矫正。
7. 颗粒挑选（先手动）
   box size一般设置成颗粒半径的两倍。本例中，在20张图片中挑选出100左右个颗粒。尝试捕捉顶部和侧面视图的多样性。
   左键选中颗粒，右键取消选中。可以使用低通滤波器滑块来调整显微照片的显示，和在需要时调整box size。
8. 颗粒挑选（基于模板）
   二维分类。（这里分成10类。）然后在分类结果里选择最清晰可靠的几个类（这里分别选择了顶部和侧面两个较清晰的类）。
   然后基于这两个类作为模板，进行自动颗粒挑选。
9. 检查挑选结果。
   直方图显示了所有拾取位置的统计信息，包括假阳性和真颗粒。真实粒子通常具有较高的NCC评分（表示与模板的形状一致）和较高的功率评分（表示信号的存在）。功率太小的挑选大概率是冰（背景），功率很大的可能是碳边缘、冰晶和堆积的颗粒。
10. 提取颗粒。从显微照片中提取颗粒。
11. 二维分类。大约分成50类(≈15min)。
12. 选择二维分类结果。
13. 从头开始的重建。
14. 均匀细化。
15. 锐化。
    需要输入B-Factor，要是负值。得到map。
16. 检查流程。tree视图。