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cryoSPARC
分析一套数据中每个square中的照片良率
前期只使用relion和
cryoSPARC
内部的参数性筛选照片后做处理,没有得到很好的重构结果,所以我
王海豚3022
·
2023-11-30 06:58
[cryoEM]
cryoSPARC
简介
cryoSPARC
系统结构概述
cryoSPARC
是一个后端和前端高性能计算软件系统,为单颗粒冷冻电镜提供数据处理和图像分析能力,以及丰富的基于浏览器的用户界面和命令行工具。
吃吃今天努力学习了吗
·
2022-11-30 12:19
冷冻电镜三维重建
cryoSPARC
冷冻电镜
[cryoEM]
cryoSPARC
入门教程:处理T20S Proteasome
官方教程指路创建新的job(快捷键:N)在该job中,创建新的workspace(快捷键:N)下载数据集(约8G)。命令:cryosparcmdownloadtest,然后解压tar-xfempiar_10025_subset.tar。导入Movies。运动矫正。CTF矫正。颗粒挑选(先手动)boxsize一般设置成颗粒半径的两倍。本例中,在20张图片中挑选出100左右个颗粒。尝试捕捉顶部和侧面视
吃吃今天努力学习了吗
·
2022-11-30 12:19
冷冻电镜三维重建
cryoSPARC
冷冻电镜三维重构
单颗粒分析
cryoEM
冷冻电镜聚类中心(2D Class)粒子图像的解析
冷冻电镜粒子图像聚类:ImportParticles:读取原始的冷冻电镜粒子图像2DClass:2D聚类,获取聚类中心的清晰粒子图像下载图像的聚类中心(MRC文件)和标签信息(CS文件):MRC:
cryosparc
_P1
SpikeKing
·
2022-08-10 18:23
深度学习
聚类
机器学习
算法
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