cryoEM

2022-01-28

研究人员表明，他们可以应用高分辨率冷冻电子显微镜（cryoEM）数据来快速表征由疫苗或感染引发的抗体，这些抗体在原子水平上与病毒上的所需靶标结合。该方法使用了一种“结构-序列”
图灵基因·2023-07-20 03:56

ChimeraX cryoEM 可视化教程：细菌ATP合酶

www.rbvi.ucsf.edu/chimerax/data/stanford-jul2019/tutorial.html这篇ChimeraX教程将着眼于如何可视化细菌ATP合成酶在3.0和3.2A分辨率下由CryoEM
黑曜、·2023-02-06 09:17

Alphafold在预测蛋白质折叠方面完爆人类，AI+X将迎来新时代

其准确性可以与使用冷冻电子显微镜（CryoEM
派派AI学院·2022-12-24 13:27

【冷冻电镜】Relion4.0——subtomogram教程

不得不说Relion是用过的cryoEM和cryoET里最好用、教程最详细最贴心的，respect。就是安装的时候有些许麻烦，使用体验还是不错的。
吃吃今天努力学习了吗·2022-11-30 12:20

【CryoEM】FSC, Fourier Shell Correlation简介

FourierShellCorrelationFourierShellCorrelation(FSC)是冷冻电镜单颗粒分析获得的生物大分子三维结构的可靠性度量指标。FSC由下式（归一化互相关）表示为空间频率的函数。这里F1(k)F_1(k)F1(k)、F2(k)F_2(k)F2(k)是任意两组独立的TEM图像重建的两种结构的三维傅里叶变换。F2(k)∗F_2(k)^*F2(k)∗是复共轭，∑K,△
吃吃今天努力学习了吗·2022-11-30 12:49

[cryoEM] cryoSPARC简介

cryoSPARC系统结构概述cryoSPARC是一个后端和前端高性能计算软件系统，为单颗粒冷冻电镜提供数据处理和图像分析能力，以及丰富的基于浏览器的用户界面和命令行工具。Master-worker模式系统基于主用户模式。主进程（web应用，核心应用程序和MongoDB数据库）一起在主节点上运行。主节点需要相对轻量级的资源（２+CPU=9.2,<=10.2(workernodesonly)GCC、
吃吃今天努力学习了吗·2022-11-30 12:19

[cryoEM] cryoSPARC入门教程：处理T20S Proteasome

官方教程指路创建新的job（快捷键：N）在该job中，创建新的workspace（快捷键：N）下载数据集（约８G）。命令：cryosparcmdownloadtest，然后解压tar-xfempiar_10025_subset.tar。导入Movies。运动矫正。CTF矫正。颗粒挑选（先手动）boxsize一般设置成颗粒半径的两倍。本例中，在20张图片中挑选出100左右个颗粒。尝试捕捉顶部和侧面视
吃吃今天努力学习了吗·2022-11-30 12:19
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