关于使用Cytoscape软件合并多个网络图

发布于2021年10月22日       

最近在使用Cytoscape绘制 基因-转录因子 的调控网络图，想绘制这种包含正负调控关系以及对样本的调控关系的网络图。

虽然很简单的方法，但是网上的帖子基本都是在水，这里给出一个简单绘制该网络图的方法。

 首先文件里应该标明网络图里的对象关系

 然后根据表格，构建两个网络图

第一个，将转录因子作为source Node，将target_gene作为target Node：

 第二个，将target_gene作为source Node，将sample作为target Node：

 然后在“tools”选项卡中找到“Merge”，“Networks”，选择刚才的两个网络，就会正常需要的一个调控网络了。