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在TCGA上下载数据并且进行处理

  1. 浏览器搜索TCGA GDC进入网站
  2. 在TCGA数据库主页选择“Repository”模式在TCGA上下载数据并且进行处理_第1张图片
  3. 根据所需要的选项在侧边栏选择数据
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    在TCGA上下载数据并且进行处理_第3张图片
  4. 清空购物车！！第一次登陆可忽略在TCGA上下载数据并且进行处理_第4张图片
  5. 将刚刚选择好的数据加入购物车，并且在购物车里下载Metadata和Cart数据，下载到同一个文件夹下。
    在TCGA上下载数据并且进行处理_第5张图片
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  6. 使用R语言脚本对数据进行处理，将其提取为gene symbol和样本的数据，推荐看一下该博主处理数据！！真的非常详细！他R语言脚本在这个链接里

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