r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)

r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第1张图片 前面我给大家介绍了网状meta分析的相关知识:
  • 网状Meta分析的步骤,看完这篇就懂了
  • 读一篇JAMA上的范文掌握网状Meta分析的制作
  • 32条军规完成网状Meta分析的制作
同时也介绍了怎么用stata绘制网状Meta分析网状图(网状Meta分析中网络证据图的绘制(Stata版)),今天我们继续来学习,给大家介绍在R语言中绘制网状图的方法。 首先我们需要准备好数据,数据跟上次演示的数据一样,在公众号后台回复“网络meta”获取数据。 连续性变量:有5种治疗方法,这里用1,2,3,4,5来代替 r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第2张图片 二分类变量:有4种干预措施,这里用1,2,3,4代替。 r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第3张图片 下面介绍用R绘制网状图的步骤,关于R和Rstudio的安装就不再介绍了,前面的文章都写过。 1. 我们打开Rstudio,第一步仍然是 设置工作路径 ,然后把数据文件都放到路径文件夹下。 r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第4张图片 在R语言里设置工作路径为D盘data文件夹。 314e2535ed1e70e1911e509421f8092b.png 2. R语言进行网状Meta分析主要就是通过件 gemtc 程序包 调用对应的  rjags 程序包 来执行的,所以 第二步需要安装gemtc包,并且调用gemtc和rjagscb7dfdc3ae6a711fd67473342e2ecda3.png 3. 导入数据,分别导入连续性变量和二分类变量,注意数据格式为csv格式。导入后分别赋值为 plotdata1(连续性变量)和plotdata2(二分类变量) r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第5张图片 导入后在data中可以看到数据。 r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第6张图片 4.设置标签,连续性变量有5种干预措施,分别定义为A,B,C,D,E五种治疗,赋值为 treatments1 。二分类变量有4种干预措施,分别定义为F,G,H,I四种治疗,赋值为 treatments2r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第7张图片 r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第8张图片 5.绘制网状图,分别绘制连续性变量和二分类变量的网状图。 连续性变量:注意 红色标注 的部分,注意和二分类变量区分。每一行都有对应的功能说明,可以自行修改。 r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第9张图片 执行后即可绘制出下面的网状图 r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第10张图片 二分类变量: 代码跟上面的一样。 r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第11张图片 执行后即可绘制出下面的网状图 r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第12张图片 这里要提到的是,如果样本量非常大,建议把上面代码中的样本量加权节点代码(下图)删除掉,不然做出来会非常紧凑。 节点加不加权不影响论文的发表。 4ca4eee14a9b9e9d02d5f62ed47edb56.png 通过修改代码里的数值可以进一步修正网状图,也可以导出为PDF后在 Adobe illustrator 里修改。 r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第13张图片 在AI软件中可以对线条、节点、标签进行各种修改。 r语言 精美rda图_网状Meta分析中网络证据图的绘制(R语言版)_第14张图片 好了,今天的分享就到这里,网状图相信大家已经会了,下一期会介绍网状meta分析下面的步骤。

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逍遥君:南京医科大学博士,主治医师,发表论文20余篇,第一作者或通讯作者SCI论文8篇,主持国自然及各级别课题多项,著有《逍遥君说科研系列课程》,主讲Meta分析、基金标书、论文写作,丁香园、募格学术特约讲师,同时具有多年基金、股市、P2P、数字货币投资经验。

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