图划分(Graph Partition&Re-ordering): METIS（5.x）&ParMETIS(4.x)使用实践

图划分(Graph Partition&Re-ordering): METIS（5.x）&ParMETIS(4.x)使用实践

学习METIS&ParMETIS用法：阅读手册和示例程序。

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总结

• METIS主要API说明

  API	说明	备注
  METIS_PartGraphRecursive	输入图数据(Graph Data)，使用multilevel-recursive-bisection方法划分图数据	输入CSR格式(xadj,adjncy)
  METIS_PartGraphKway	输入图数据(Graph Data)，使用multilevel k-way方法划分图数据	输入CSR格式(xadj,adjncy). 对于比较大数目(partitions)划分，建议使用此种方法
  METIS_PartMeshDual	输入网格数据(FEM/FVM Mesh),根据网格对偶图进行划分	输入mesh格式(eptr,eind),比较适合FVM类型问题
  METIS_PartMeshNodal	输入网格数据(FEM/FVM Mesh),根据网格节点图进行划分	输入mesh格式(eptr,eind),比较适合FEM类型问题
  METIS_NodeND	使用multilevel-nested-dissection算法，计算稀疏矩阵的fill-reducing-ordering 行列交换重排序	输入CSR压缩格式

• ParMETIS主要API函数说明

• 使用情况

  PETSc中使用METIS对稀疏矩阵进行Ordering和Partition; OpenFOAM用METIS对计算区域进行并行划分(decomposePar); SuperLU_dist和MUMPS求解器在进行LU分解之前，会用METIS对稀疏矩阵的列进行重排序(Pc)