在新建conda环境时,没有先回到base环境,而是在py3.6这个环境下新建,结果导致新建的snakemake成了py3.6的子环境。
利用 conda-env list 指令查看时,不能看到子环境的名称, 类似以下形式
$ conda-env list
# conda environments:
#
base * ~/miniconda2
py3.6 ~/miniconda2/envs/py3.6
~/miniconda2/envs/py3.6/envs/snakemake
r35 ~/miniconda2/envs/r35
如果先进入到py3.6,则看不到其他同级环境的名字,而py3.6显示为base
$ conda-env list
# conda environments:
#
~/miniconda2
base * ~/miniconda2/envs/py3.6
snakemake ~/miniconda2/envs/py3.6/envs/snakemake
~/miniconda2/envs/r35
此时使用命令 conda remove -n snakemake --all
或者 conda-env remove --name snakemake
都无效,无输出无报错
指定要删除的环境的路径,使用-p
参数而不是-n
参数,即可解决问题,即conda remove -p ~/miniconda2/envs/py3.6/envs/snakemake --all
或者 conda-env remove -p ~/miniconda2/envs/py3.6/envs/snakemake
其中要注意conda-env remove没有–all参数,默认删除整个环境