SSR、SNPs、RAPD和AFLP的概念

SSR、SNPs、RAPD和AFLP的概念

SSR

合成与高度重复的卫星DNA两侧序列互补的特异引物，进行PCR反应的技术，是研究DNA多态性的一种分子标记技术。

SNPs的概念、检测与应用

SNPs是Single Nucleotide Polymorphisms的缩写，称为单核苷酸多态性。简单地讲，它是指基因组DNA序列中由于单个核苷酸（A,T,C,G）的替换而引起的多态性。因此，通常所说的SNP不包括碱基的插入、缺失以及重复序列拷贝数的变化

RAPD——random amplified polymorphism DNA

用任意引物进行基因组指纹分析是检测DNA多态性的一种通用方法，对遗传学、图谱绘制、系统发育学和种群生物学都很有用，

AFLP（有何用途）——amplified fragment length polymorphism

它是通过对基因组DNA 进行限制性酶切切割形成的许多限制片段加以双链接头，作为进一步扩增的模版，根据接头序列在末端再加上1-3各选择性碱基而设计引物，只有那些与引物很好配对的片段得到扩增，扩增产物在高分别率的变性聚丙烯酰氨上电泳而加以分开而被检测。可检测50-100各位点，这便可以作为遗传图谱与物理图谱中的路标，同时可以检测群体基因组和克隆DNA片段，为遗传和物理图谱之间构建一个桥梁。