今天主要是学习软件安装-Linux环境下的软件安装
简单介绍一下概念
-conda是大Boss，最初为管理python包而建立，它是一个大的涵盖许多领域的软件包管理器。
-anaconda是总管，职务比conda低，但干的活不少，也是个有内涵的家伙
-miniconda是区域经理，说白了就是干事的，而且比较专一，主要负责生信领域
准备工作
- 检查putty中有没有bzip2，如果没有，就输入
yum install -y bzip2进行安装
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下载miniconda 链接是花花给的：https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
安装miniconda
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激活
添加国内镜像
使用conda
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查看当前所有软件列表
conda list
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搜索软件
conda search fastqc【这里以数据质控软件fastqc为例】
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安装软件
conda install fastqc -y
99.png 卸载软件
conda remove fastqc -y
conda 环境的学习（以下文字描述摘自生信星球）
1.先查看当前conda有哪些环境
conda info --envs(前面带*的就是默认的)
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2.比如我们要处理转录组数据了，好，先建立一个名叫rnaseq的conda环境，然后指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomatic（这两个可以一步完成）
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
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3.创建完之后，再次查看一下我们的conda环境，conda info --envs，看是不是多了一个rna-seq。但是发现，默认还是base
我们该激活新的conda环境了source activate rna-seq，这时默认的*就会转移到rna-seq前面；
另外你会发现在用户名root前面出现了(rna-seq) ;
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接着，你可以输入fastqc试试，如果出现下面的一大片信息就说明可以使用了（了解一下：其实这些是帮助信息，你只输入了一个软件名称，没有给他跟上操作对象，所以他不会执行命令，就给你显示帮助文档让你看看，虽然，，并不需要仔细看，就是给你提供下安全感而已）
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4.如何卸载一个环境中的软件
- 卸载某个软件conda remove -n rna-seq fastqc -y
- 全部卸载，也就是卸载这个环境conda remove -n rna-seq --all
- 注意：最后卸载环境的时候，需要先退出当前环境，因为自己肯定不能把自己删除吧