比较TCGA正常组织与肿瘤组织表达量不能更方便

在开发UCSCXenaShiny这个包过程中开发了一个小工具，用于查看某个基因在肿瘤组织和正常组织中表达量的差异。肿瘤组织数据来源于TCGA，正常组织数据来源于GTEX。

使用起来非常方便

首先安装开发版本的包

remotes::install_github("openbiox/XenaShiny")

library(UCSCXenaShiny)

接着直接调函数

#使用小提琴图

vis_toil_TvsN(Gene = "TP53", Mode = "Violinplot", Show.P.value = F, Show.P.label = F)

#使用箱型图

vis_toil_TvsN(Gene = "TP53", Mode = "Boxplot", Show.P.value = F, Show.P.label = F)

#加上P值

vis_toil_TvsN(Gene = "TP53", Mode = "Violinplot", Show.P.value = T, Show.P.label = T)

#换个配色

vis_toil_TvsN(Gene = "TP53", Mode = "Violinplot", Show.P.value = T, Show.P.label = T,value = c("Red","Green"))

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https://github.com/openbiox/XenaShiny