2022-04-25 GSVA相关

GSVA的运行注意事项
如果是芯片的数据是需要对数据进行过滤的,可以参考下面的测试数据代码,或者看官方的文档
GSVA本身提供了三个算法,一般使用默认的算法就可以了
对于RNA-seq的数据,如果是read count可以选择Possion分布,如果是均一化后的表达量值,可以选择默认参数高斯分布就可以了
读入的数据格式可以参考最后的表达谱数据格式,需要自己制作分组信息。

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